R语言--MCMC算法介绍以及例子
Markov Chain Monte Carlo (MCMC) 是一种用于随机生成满足给定分布的样本的算法。它通过构建一个马尔可夫链来模拟一个随机过程,从而生成样本。
首先,你需要选择一个初始状态,然后不断迭代,每次随机从当前状态转移到一个新的状态。转移的概率是由转移概率矩阵定义的。转移的目的是使马尔可夫链最终收敛到所需的目标分布。
在许多情况下,我们希望求出某些概率分布的期望值,但是这个分布很难直接求出。这时,我们可以使用 MCMC 算法来生成这个分布的样本,然后计算这些样本的平均值来估计期望值。
常见的 MCMC 算法有 Metropolis-Hastings 算法和 Gibbs sampling 算法。
在R语言中,可以使用库MCMCpack
来实现MCMC算法。下面是一个简单的例子,展示了如何使用MCMCpack
来拟合一个线性回归模型:
# 首先,需要安装并加载MCMCpack库
install.packages("MCMCpack")
library(MCMCpack)# 然后,生成一些模拟数据
set.seed(123)
x <- rnorm(100)
y <- 2 * x + rnorm(100)# 定义模型参数的初始值和先验分布
beta0 <- 0
beta1 <- 0
sigma <- 1# 定义模型的概率密度函数(即目标函数)
model <- function(y, x, beta0, beta1, sigma) {n <- length(y)yhat <- beta0 + beta1 * xlikelihood <- sum((y - yhat)^2)prior <- dnorm(beta0, 0, 100) + dnorm(beta1, 0, 100) + dnorm(sigma, 0, 100)posterior <- likelihood + priorreturn(list(likelihood=likelihood, prior=prior, posterior=posterior))
}# 使用MCMC函数进行拟合
fit <- MCMC(model, y=y, x=x, beta0=beta0, beta1=beta1, sigma=sigma)# 打印模型参数的估计值
print(fit)
在上面的例子中,我们首先生成了一些模拟数据,然后定义了模型的参数初始值和先验分布。接着,我们定义了模型的概率密度函数,并使用MCMC
函数进行拟合。最后,我们打印出了模型参数的估计值。
R语言--MCMC算法介绍以及例子相关推荐
- R语言Apriori算法实现例子
R语言Apriori算法实现例子 以西饼屋数据集为例进行分析 代码部分 第一部分 每行解读 setwd("-")#定位根目录 data.frame(table(Breakfast[ ...
- C语言metropolis方法,详解R语言MCMC:Metropolis-Hastings采样用于回归的贝叶斯估计
MCMC是从复杂概率模型中采样的通用技术. 蒙特卡洛 马尔可夫链 Metropolis-Hastings算法 问题 如果需要计算有复杂后验pdf p(θ| y)的随机变量θ的函数f(θ)的平均值或期望 ...
- R语言apriori算法进行关联规则挖掘(限制规则的左侧或者右侧的内容进行具体规则挖掘)、使用subset函数进一步筛选生成的规则去除左侧规则中的冗余信息、获取更独特的有新意的关联规则
R语言apriori算法进行关联规则挖掘(限制规则的左侧或者右侧的内容进行具体规则挖掘).使用subset函数进一步筛选生成的规则去除左侧规则中的冗余信息.获取更独特的有新意的关联规则 目录
- R语言apriori算法进行关联规则挖掘(限制规则的左侧或者右侧的内容进行具体规则挖掘)、查看限制了规则的右侧之后挖掘到的规则(置信度排序,只查看左侧即可)
R语言apriori算法进行关联规则挖掘(限制规则的左侧或者右侧的内容进行具体规则挖掘).查看限制了规则的右侧之后挖掘到的规则(置信度排序,只查看左侧即可) 目录
- R语言Apriori算法关联规则挖掘:使用interestMeasure函数评估挖掘到的规则(包括覆盖率(coverage)和FishersExactTest)、置信度最高的五条规则(top five
R语言Apriori算法关联规则挖掘:使用interestMeasure函数评估挖掘到的规则(包括覆盖率(coverage)和FishersExactTest).置信度最高的五条规则(top five ...
- 对于一些常用的R语言的算法包的归纳(修改)
基于R,仅供自食. 相信自己,每天多学一点. (part2来源:https://blog.csdn.net/LW_GHY/article/details/56501063) part1: 连续因变量的 ...
- python语言入门r_小结:jieba分词的Python与R语言基础用法介绍
当前浏览器不支持播放音乐或语音,请在微信或其他浏览器中播放 人们说话不是一个词一个词崩出来的,文章也就由句子组成.要想让机器识别美文,体会中华名族汉语的博大精深,不是不可能.但是,首先需要将其转化成其 ...
- k均值聚类算法案例 r语言iris_K-means算法原理
聚类的基本思想 俗话说"物以类聚,人以群分" 聚类(Clustering)是一种无监督学习(unsupervised learning),简单地说就是把相似的对象归到同一簇中.簇内 ...
- R语言分类算法之集成学习(Bootstrap Aggregating)
1.集成学习(Bootstrap Aggregating)原理分析: Bagging是Bootstrap Aggregating的缩写,简单来说,就是通过使用boostrap抽样得到若干不同的训练集, ...
最新文章
- 集合70多种推荐算法,东北大学老师用Java写了一个开源库,在GitHub上收获近1500个Star...
- HTML的标签描述21
- Apache Camel 2.15.0 发布,Java 规则引擎
- 业务脆弱性评估是业务持续性保障(BCM)的基础数据
- python当前日期获取程序_Python获取当前时间日期
- 钉钉自定义机器人python_使用钉钉自定义机器人发送舔狗日记[70行][python]
- 目标检测数据集PASCAL VOC简介
- ansible(1)——安装
- hda: status timeout: status=0xd0 { Busy }报错解决!
- 【洛谷P4719】动态DP【LCT】【矩阵】
- 在Spring MVC Web应用程序中添加社交登录:集成测试
- 如何成为高级测试人?
- 解决idea使用jdbc连接数据库失败的方法(针对驱动导入失败)
- 全国高校计算机能力挑战赛Java试题(一)
- 数据分析师面试题攻略
- 面经——嵌入式常见面试题总结100题(下)
- 研发人员如何开展职业规划
- 梦三国服务器每天维护几次,梦三国:都在抱怨策划,可扪心自问玩家数量逐渐减少的原因是这些...
- 生成式人工智能是否会是下一个风口?
- uniapp简单搞定支付