pasa查看mysql_PASA的安装与使用

1. PASA简介

PASA, acronym for Program to AssembleSpliced Alignments, is a eukaryotic genome annotation tool that exploits spliced alignments of expressed transcript sequences to automatically model gene structures, and to maintain gene structure annotation consistent with the most recently available experimental sequence data. PASA also identifies and classifies all splicing variations supported by the transcript alignments.

Note:

Combine genome and Trinity de novo RNA-Seq assemblies to generate a comprehensive transcript database.

2. PASA使用前的准备

2.1 Mysql数据库的准备

创建只读权限用户和所有权限用户各一个。mysql> GRANT SELECT ON *.* TO 'pasa'@'%' IDENTIFIED BY '123456';

mysql> GRANT ALL ON *.* TO 'chenlianfu'@'%' IDENTIFIED BY '123456';

mysql> FLUSH PRIVILEGES;

2.1 安装perl模块# cpan

cpan[1]> install DBD::mysql

cpan[1]&

pasa查看mysql_PASA的安装与使用相关推荐

查看python解释器安装路径
查看python解释器安装路径在Windows下或Linux下的pycharm中进行查看: 示例代码: import sys print(sys.executable) 运行效果: 在Linux下用 ...
linux查看安装的所有内核,Linux怎么查看系统已安装内核
当我们需要在Linux系统中安装一些软件而去下载安装文件时,一般都需要确认到底下载哪个版本的安装包,这就需要我们知道自己的Linux系统到底是什么版本.什么内核,下面跟着学习啦小编一起来了解一下Lin ...
如何看电脑安装了python-Python教程第1篇：查看电脑是否安装python
所谓工欲善其事,必先利其器,咱们在后续使用python之前,肯定是需要先进行python环境安装.当前,Python2在2020年1月1日官网已经不再维护. 所以,对于新人学习和使用python来说, ...
查看python安装路径-在cmd中查看python的安装路径方法
我相信一定有很多的人跟我一样,经常忘记Python安装的路径,每当用到的时候,最笨的办法就是在全局电脑里,直接查找Python,这样是肯定能查到的,但是如果你的电脑文件超级多,这将是一个工厂量很大的事 ...
ubuntu查看cudnn是否安装成功_深度学习之目标检测系列（0） -ubuntu18.04+RTX2080Ti+cuda+cudnn安装...
ubuntu18.04使用cudnn的过程中会遇见很多问题,而且搜索很多文章发现比较杂乱,我这里总结一下,方便小伙伴少走几步坑. 我的服务器硬件配置信息 (2019-01购买) CPU: 英特尔(in ...
Linux下查看MySQL的安装路径
Linux下查看mysql.apache是否安装,并卸载. 指令 ps -ef|grep mysql 得出结果 root 17659 1 0 2011 ? 00:00 ...
查看python内部模块命令，内置函数，查看python已经安装的模块命令
查看python内部模块命令,内置函数,查看python已经安装的模块命令可以用dir(modules) 或者用 pip list 或者用 help('modules') 或者用 python -m ...
Linux 查看数据库MySQL安装文件和安装目录的命令
文章目录数据库 MySQL 相关目录说明 /var/lib/mysql /usr/bin /usr/share/mysql /usr/lib/mysql /etc/my.cnf 查看 MySQL 相 ...
linux显示系统信息软件下载,linux查看系统信息软件安装信息命令学习笔记
查看LINUX安装版本 [root@localhost etc]# uname Linux [root@localhost etc]# uname -a Linux localhost.localdo ...

pasa查看mysql_PASA的安装与使用

pasa查看mysql_PASA的安装与使用相关推荐

最新文章

热门文章