R语言 image.binarization: 包_想提高文章的引用率?写个R包吧!- 工具准备篇
前言
R语言程序包是R语言的灵魂,是R语言的核心,每一个R语言用户都会使用到R包。2006年3月15日,第一个R包(coxrobust)加入CRAN,截止2020年5月17日,已经有超过15000个R包,这些R包涵盖了各个领域,解决了各种各样的问题。
R包的易用性是R广受欢迎的重要原因,R包开发简单、易学,使得各行各业的从业者,即使是非计算机人员,都可以加入到R的编程中来,带来了R繁荣的景象。
既然这么多R包,那还有写包的必要吗?答案是肯定的,现实中的问题千千万万,15000个R包并不能解决所有问题。
如果R包足够实用,确实帮大家解决科研中遇到的统计和可视化问题,大家在应用你的R包的时候自然会引用你介绍R包的文章,自然文章引用量会指数级上涨!
本教程将从零教你如何制作、发布自己的R包。
写包的好处
• 彰显自己的实力!你说你会R,凭啥?有了自己的R包,也是一种实力的体现
• 创造!code changes world!学会写代码,那么你就可实现自己的想法,甚至做出创新的事物
• 软件著作权!你的原创代码可以申请软件著作权,进一步提升自己
• 发表论文!如果你的包是一个创新,可以写论文发表,让更多的人使用
• 完善方法学!不断地修正自己的代码,不断的完善,会加深你对代码和方法学的理解
• 方便自己!即使你不准备发布你的R包,也能方便自己的工作
安装必备工具
制作R包需要的工具有:电脑1台、R软件、RStudio软件、Rtools软件、devtools包、roxygen2包。下面我来详细讲一下安装过程。
1 电脑、R软件、RStudio软件自行安装
电脑的系统可以是windows、macos、linux。R软件及RStudio软件推荐使用最新版本。
2 Rtools软件的安装
许多人误以为Rtools是一个R包,所以会使用install.packages("Rtools")命令来安装,其实是不对的,Rtools其实是windows系统下的软件。
在windows和macos中,Rtools会随着安装RStudio的时候一起安装,如果没有安装,那么windows系统需要自行安装Rtools,macos需要安装Xcode。他们的作用是编译和解析命令。
windows系统Rtools软件的网址是:https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/ ,根据自己当前使用的R版本,下载对应版本的Rtools软件。比如,我当前使用的R版本是3.6.2,那么我选择下载Rtools35.exe。
下载完成后,双击Rtools35.exe进行安装。
Rtools并不支持中文,我们可以选择英语,点击OK即可。
接下来会告诉你Rtools主要用来创建R语言的应用,对于windows系统来说,需要将其添加入环境变化。
安装的默认地址是C:Rtools,建议不要修改。
安装的形式,我们直接使用推荐的就可以。
最关键的一步:Add rtools to system PATH,一定要勾上,表示加入电脑的环境变量。
这里问我们要不要修改环境变量,我们看到C:Rtoolsin已经被加入到了PATH中,我们不需要再次对其进行编辑。
再次核对一下安装信息。点击Install,开始安装。
开始安装。
安装成功!
3 安装依赖包
R包的制作依赖于devtools包和roxygen2包,在这两个包出现之前,制作R包是一件十分繁琐的事情,许多事情需要手动完成,一有不慎,就会出错,修改说明文档更加痛苦。
devtools包的出现,尤其是在RStudio软件加入了devtools的功能后,R包制作变得十分简单。
如果说devtools包让制作变得简单,那么roxygen2包彻底解放了R包开始者,我们再也不用为复杂的注释而头疼,可以一边写函数,一边写注释,将精力集中到写代码中,最后运行devtools::document()命令,就可以直接将所有注释写入R的说明文档。
devtools包和roxygen2包的安装命令是
install.packages(c("devtools","roxygen2"))
检查
最后,我们使用命令devtools::has_dev()来检查一下准备工作。运行这行命令,返回“Your system is ready to build packages! ”表示一切准备就绪,可以开始了。
- library(devtools)
- has_devel()
小结
工欲善其事必先利其器,今天和大家分享了R包制作的必备工具,这些准备工作做好了,就可以开始制作R包了。
致谢
再次致谢R语言及RStudio软件开发团队,他们出色的工作给我们带来了极大的便利。
放眼望去,近几年,很多人都有这样一种感受,那就是现在的科研要求越来越高,论文发表越来越难。
这主要是因为当前竞争越来越大,优质科研成果及高水平论文越来越多,学术市场水涨船高。现在,要想在学术生涯获得良好发展,手握高分论文已经成了通行证。这不仅是对科研人员,对硕博生们也是如此。对于硕博生们来说,优质的论文更是获到学术自信,确保顺利毕业、获得满意工作的决定因素,根本无法忽视。
但是说到这里,很多人可能就抱怨了:现在发论文,真的很难很难啊!
所以,我很想把一个优质的课程推荐给大家!一个可能改变所有医学生一生的课程。
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