linux双机连通找不到con1,Linux服务器崩溃 - 错误在反序列化（节点$ CON）：错误的连接...

我运行Linux集群内中的R读码 - 该代码是复杂的(超过两千行代码)，涉及超过40个R包和几百个变量。但是，它在Windows和R.

的Linux版本，我现在正在运行爱丁堡大学EDCF高性能计算集群上运行的代码都和代码并行运行。并行代码在DEoptim中调用，基本上，在初始化后，并行运行一系列函数，并将结果发送回DEoptim算法，并将其作为绘图和数据表保存在我自己的空间 - 重要的是代码运行和工作！

的代码模型区域的水文，我可以设置密码了我想要的任何时间内，模拟历史条件 - 从一天到30年。平行一个月，结果大约每隔70秒吐出一次，而DEoptim算法只是不断重新运行代码，改变输入参数，试图找到最佳参数集。

该代码似乎运行良好的一些运行，但最终崩溃。昨晚的代码完成了一个100组的运行没有问题了大约2个小时，但最终坠毁 - 它总是最终崩溃 - 错误代码：

Error in unserialize(node$con) : error reading from connection

我登录到该系统是一个16核服务器( 16个真正的核心)根据：

detectCores()

我要求8GB的2GB内存插槽。我试图在24内核的机器上运行这个内存大的内存请求(4个40GB的内存插槽)，但它最终还是会崩溃。这段代码在Windows计算机上运行良好，并且在8台逻辑内核上并行运行数千个结果。

所以我相信代码是好的，但为什么它崩溃？它可能是一个记忆问题？每次调用它时，它都包含：

rm(list=ls())

gc()

或者它只是一个核心崩溃？我确实认为，如果两个内核试图同时写入同一个数据文件，可能会出现问题，但我暂时将其删除，并且仍然崩溃。有时会在几分钟后和其他几次后崩溃。我试图从并行代码中删除一个核心使用：

但它仍然崩溃。

无论如何，该代码可以修改，因此它拒绝崩溃的输出，例如如果错误然后拒绝并继续！

或者，是否有修改代码来捕获为什么在所有发生的错误的方法吗？

我知道有很多其他序列化(节点$ con)和反序列化(节点$ con)错误帖子，但他们似乎没有帮助我。

我真的很感谢一些帮助。

谢谢。

您可以尝试将有问题的代码包装到'tryCatch'中，并将结果和对象输出到文本/ .RData文件。 –

我想知道如何使用tryCatch - 听起来是可能的。 –

我创建了另一篇文章，试图了解如何使用tryCatch与我的代码http://stackoverflow.com/questions/33733102/how-to-use-trycatch-in-r-with-parallel-code –

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