2019独角兽企业重金招聘Python工程师标准>>>

问题

有两个样本,二者之间有些序列是重复的,因此其中一个过滤掉了重复的序列后才进行 Blast2go 分析,,另一个则全体。 现在需要把过滤掉那部分序列的也给合并过来。

思路

可以根据序列 id,直接 grep xxxx *.xml,从另一样本那里获得 XML 文件,然后拷贝到新的目录下,再导入到相应 b2g 文件中。

# 例如
grep -P '\bTSA_246786\b' *.xml

注意:

  • 在脚本里要转义:\\b
  • Blast2go 本地 BLAST 的结果格式为 XML2

虽然有点慢,但的确可行,毕竟 BLAST 只会更慢,咱没有服务器,只有破电脑一台。

转载于:https://my.oschina.net/u/727594/blog/870135

提取Blast2go blast结果中的一部分相关推荐

  1. php截取剩余部分,PHP从字串中截取一部分,支持使用(*)模糊截取

    <PHP从字串中截取一部分,支持使用(*)模糊截取>要点: 本文介绍了PHP从字串中截取一部分,支持使用(*)模糊截取,希望对您有用.如果有疑问,可以联系我们. 有时会有这种需求,就是从一 ...

  2. 用STM32实现:摄像头扫到二维码后提取二维码中的信息分别放到数组中

    摄像头扫到二维码后提取二维码中的信息分别放到数组中 把想要的信息编辑好放到二维码中(网上有好多在线生成二维码的工具) /** *作者:魏波 *时间:2017.6.6 * **/char name[6] ...

  3. python读取路径中字符串_python实现提取str字符串/json中多级目录下的某个值

    字符串多级目录取值: 比如说: 你response接收到的数据是这样的. 你现在只需要取到itemstring 这个字段下的值.其他的都不要! 思路就是:字符串是个json格式(或转为json格式), ...

  4. py提取文字中的时间_一次提取100个视频中的文案!节省时间有绝招在手视频文案提取...

    关于一段视频中的文案,我们常常会遇到想要提取的时候,可能有些人会说这还不简单,直接边听边写就是了,是的这确实是一个方法,如果只有少数的视频,少数的文案需要提取的话,但是如果你们遇到工作上的安排让你们提 ...

  5. python层级抓取_python实现提取str字符串/json中多级目录下的某个值

    字符串多级目录取值: 比如说: 你response接收到的数据是这样的. 你现在只需要取到itemstring 这个字段下的值.其他的都不要! 思路就是:字符串是个json格式(或转为json格式), ...

  6. linux系统的4个部分,以下是Linux文件系统的4个相关的结构定义中的一部分: Struct i..._考试资料网...

    问答题为了实现文件的共享,办法之一是把文件目录分成基本文件目录和符号文件目录.现设目录文件存放在磁盘上,盘块长度为1024B,每个文件说明占48B.其中,文件符号名占6B,内部标识符ID占2B,请回答 ...

  7. php转换图片属性a,PHP 提取图片img标记中的任意属性

    /* PHP正则提取图片img标记中的任意属性 */ $str = ' PHP正则提取或更改图片img标记中的任意属性'; //1.取整个图片代码 preg_match('/]*?src\s*=\s* ...

  8. aip格式转化为pdf_python提取pdf文档中的表格数据、svg格式转换为pdf

    提取pdf文件中的表格数据原文链接 https://www.analyticsvidhya.com/blog/2020/08/how-to-extract-tabular-data-from-pdf- ...

  9. android 抓取webview中的所有图片_如何一键提取PDF文档中的所有图片?

    原标题:如何一键提取PDF文档中的所有图片? 目前PDF文档被大家广泛应用,主要是因为PDF文档在传输和转换的过程中比较稳定,所以PDF格式几乎是办公文件格式的首选.大家都知道PDF文档转换格式以及编 ...

  10. 怎样把php网站转为h5,【php】php如何把网页中的一部分生成.jpg

    现在有一个需求把网页中的一部分(用户面板,蛮复杂的)生成图片,请问用php如何实现 回答 这个得客户端跟服务端结合起来了 截图是客户端的事情 保存是PHP的事情 用ActiveX 还是 Java Ap ...

最新文章

  1. python的心得体会200字_python_学习心得
  2. Java能做什么?学完Java可以从事什么工作呢?
  3. LeetCode Divisor Game
  4. 技术干货 | 应用上线前的“体检”,你知道需要检测哪些指标吗?
  5. day63-webservice 08.在web项目中配置带有接口的webservice服务
  6. ActionBarSherlock SlidingMenu整合,解决SlidingMenu example的getSupportActionBar()方法不能用问题
  7. android uses-permission 配置详解
  8. mac头和ip头部详解
  9. 24小时动手学prezi入门到精通+破解(全能“破解”软件)
  10. 有限自动机DFA 、 无限自动机NFA
  11. java.lang.Byte cannot be cast to java.lang.Integer,sql 到 java 类型转换遇到的问题
  12. 【C】求函数的定积分
  13. IVL和SVL的区别
  14. idea报错:fatal: –author ‘user@mail.com’ is not ‘Name ’ and matches no existing author
  15. 将工件模型(stp,stl等)转为均匀稠密点云(pcd,ply)
  16. 微信摇一摇抽奖的H5制作思路
  17. 招聘 iOS 全栈工程师 欢迎加入 ArcBlock 中国研发中心
  18. 微信小程序onPullDownRefresh onReachBottom实现下拉刷新上拉分页加载
  19. 如何合并多段视频素材并添加背景图片
  20. 计算机量子化学计算中HF单位,21世纪高等院校教材·量子化学基础

热门文章

  1. 求圆周长、圆面积、圆球表面积、圆球体积、圆柱体积。用scanf输入数据,输出计算结果
  2. Verilog 练习 简单状态机代码设计(三角波发生器)
  3. LoadLibrary加载dll失败, 报告找不到指定的模块 的问题的解决
  4. Image Caption 常用评价指标
  5. 【游戏】Win 10 运行红色警戒2
  6. 灵感爆发:An/flash 影片剪辑动画播放一遍后,摆脱paly()的控制
  7. 中国SaaS产品成功四要素和四层次
  8. Java直接运行JavaScript代码或js文件
  9. Android中浏览PDF文件
  10. Invalid regular expression flags 错误