1、四极杆质谱仪，QMS

QMS是最常见的质谱仪器，定量能力突出，在GC-MS中QMS占绝大多数。

优点：

结构简单、成本低；

维护简单；

SIM功能的定量能力强；

是多数检测标准中采用的仪器设备。

缺点：

无串极能力，定性能力不足；

分辨力较低(单位分辨)，存在同位素和其他m/z近似的离子干扰；

速度慢；

质量上限低(小于1200u)。

2、飞行时间质谱仪，TOFMS

TOFMS是速度最快的质谱仪，适合于LC-MS方面的应用。

优点：

分辨能力好，有助于定性和m/z近似离子的区别，能够很好的检测ESI电喷雾离子源产生多电荷离子；

速度快，每秒2～100张高分辨全扫描(如50～2000u)谱图，适合于快速LC系统(如UPLC)

质量上限高(6000～10000u)；

缺点：

无串极功能，限制了进一步的定性能力；

售价高于QMS；

较精密，需要认真维护。

3、三重四极杆质谱仪，QQQ

QQQ质谱给四极杆质谱仪在保留QMS原有定量能力强的特点上，提供了串级功能，加强了质谱的定性能力，检测标准中常作为QMS的确认检测手段。

优点：

有串极功能，定性能力强

定量能力非常好，MRM信噪比高于QMS的SIM

是常用的QMS结果确认仪器

除一般子离子扫描功能外，QQQ还具有SRM、MRM、母离子扫描、中性丢失(Neutral loss)等功能(离子阱不行)对特征基团的结构研究有很大帮助

缺点：

分辨力不足，容易受m/z近似的离子干扰

售价较高

需要认真维护

4、四极离子阱，QTrap

技术上而言，在传统QQQ的四极杆中加入了辅助射频，可以做选择性激发；或者就功能而言，为QQQ提供了多级串级的功能

优势：

同时具备MRM、SRM、中性丢失和多级串级功能，非常适合于未知样品的结构解析

缺点：

分辨力还是略低

5、线性离子阱，Linear Ion Trap

传统3D离子阱的增强版本

优点：

相对于传统3D离子阱，灵敏度高10倍以上

多级串级质谱

缺点：

相对于QQQ，还是不能做MRM、中性丢失等特征基团筛选功能

线型离子阱和三维离子阱的比较：

这个比较可能是很少有的一边倒的场面——线型离子阱的灵敏度、分辨力、速度、通量等指标均优于传统的3D离子阱。

自从2003年Finnigan公司推出了LTQ线型离子阱之后，由于专利的问题其他公司不能生产线型离子阱，一时间众多厂家的3D离子阱销量下降很多。3D离子阱的市场被线型离子阱蚕食的非常严重，特别是在中国质谱市场，由于用户爱追新潮、求大求好，线型离子阱在中国卖的很好。以至于在很多时候Bruker和Agilent的离子阱广告都看不见了。但是实际上线型离子阱在国外并不是非常流行，特别是一些离子阱的老用户，由于已经习惯了离子阱的指标，对于价钱高很多的线型离子阱往往只叫好不出手，宁可买只要3/5价钱的LCQ这种老式3D离子阱。又便宜又好用哦。

6、四极杆飞行时间串联质谱，QTOF

QTOF以QMS作为质量过滤器，以TOFMS作为质量分析器。

优点：

能够提供高分辨谱图

定性能力好于QQQ

速度快，适合于生命科学的大分子量复杂样品分析

缺点：

成本高

需要仔细维护

7、离子阱-飞行时间质谱，Trap TOF ? ? ??

以3D离子阱作为质量选择器和反应器，结合了离子阱的多级质谱能力和飞行时间质谱的高分辨能力

优点：

同时具有多级串级和高分辨能力，适合于未知样品的定性工作，如糖蛋白的定性

缺点：

由于离子阱容量限制，对于混合样品的灵敏度欠佳

定量能力弱

8、磁质谱，Sector MS

磁质谱的定量能力是各种质谱中最强的。现在已较少使用，仅用于地质元素和痕量二恶英的检测。

优点：

技术经典、成熟，NIST等MS库采用的仪器

分辨力非常好(100k，m/&Delta m FWHM)，干扰少

灵敏度高，定量能力是各种质谱中最好的

缺点：

体积、重量大

售价很高

速度慢

维护复杂，很费电