通过在Excel中求解相关系数,后在R语言里绘制相关系数图。

1 求解相关系数

(1)在Excel中,选择:数据→数据分析→相关系数,点击确定。

(2)输入区域,框选D2至FX17列,这里,不要框选第一行(第一行是波段号)。点击确定。

(3)这样,生成了一张新数据表Sheet4,记录了所有列数据两两的相关系数。新建一个Sheet5,将A、B两列数据数据出来,放到Sheet5中。这两列数据,就是叶绿素含量与全部176个波段的相关系数。

2 数据准备

将相关系数矩阵,单独拷贝到一个EXCEL文件中,保存为data1,准备导入R语言。

3 打开R语言

(1)打开R语言,并导入数据

(2)安装和调用软件包

install.packages("pheatmap")

出现下述代码表示安装成功

4 绘制波段间相关系数热力图

输入代码:

library(pheatmap) #加载pheatmap包
pheatmap(data) #绘制热力图

得到所有波段间相关系数热力图:

自定义颜色,使用红黄蓝色系

pheatmap(data,display_numbers=F,color=colorRampPalette(rev(c("red","yellow","blue")))(102))  

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