中药资源中心是以中国中医科学院中药资源学科优势为基础，整合国内研究力量，建成的国家级中药资源研究和实践的平台。主要职责是全面承接全国中药资源普查成果，开展中药资源基础和应用研究及成果转化，进行中药资源的动态监测及生产适宜性区划，承担国家中药新药开发的中药资源可持续利用评估。

中心被遴选为科技部重点领域“中药资源创新团队”及“中药生态农业创新团队”，是道地药材国家重点实验室培育基地的依托单位, 是中国中药协会中药生态农业专业会委员会、中华中医药学会中药鉴定专业委员会、中国生态学学会中药资源生态专业委员会、中国中西医结合学会分子生药学专业委员会、中国中药协会中药资源多样性与经济专业委员会（TEEB）、中国植物学会药用植物及植物药专业委员会、世界中医药学会联合会药用植物资源利用与保护专业委员会、中国药学会中药资源专业委员会、全国中药材种子（种苗）标准化技术委员会9个专业学会的挂靠单位。

目前有国家中医药管理局道地药材生态遗传、中药资源遥感监测与区划2个重点研究室；国家中医药管理局中药资源生态、分子生药2个三级实验室；国家中医药管理局分子生药学（培育）、药用植物学和中药鉴定学3个重点学科。是国家中医药管理局“一带一路”药用植物资源开发与利用基地。也是北京市道地中药功能基因组重点实验室。在中药资源普查和监测、道地药材形成机理研究、分子生药及合成生物学研究、中药材生态种植及立地条件修复、中药标准化研究等诸多领域处于国际先进和国内领先水平，形成的独特优势在国内外中药资源研究领域得到广泛认可。