macos 安装python3.8 版本_用python安装cutadapt程序
昨天用ubuntu安装了cutadapt,但是在之后的程序运行中,还是行不通。因此,今天还是在win10下用python来进行安装。
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python 的安装
来自风变编程:助教蓬蓬 2020年8月更新
《【windows】Python+ Vscode 安装文档》
https://docs.forchange.cn/docs/yTt3vQg8XcR9VgtV
《【Mac】Python+ Vscode 安装文档》
https://docs.forchange.cn/docs/KtrV9P6J8VpDWRjp
也可以通过安装conda来安装python,但要注意版本,不同版本的conda,其python版本也不同。如果安装的时候没有选择配置环境变量,之后要手动配置。
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用cmd 运行python
https://zhidao.baidu.com/question/1510889184474081700.html
cutadapt安装
https://www.cnblogs.com/xudongliang/p/6404958.html
运行提示需要python3.5以上
查看python和pip版本的命令如下:
python --version
pip list
或者
pip show pip
注意:如果系统只安装了python3,那么python就表示python3,如果2和3都有,那么运行时才区分python2和python3。
可能涉及到要给pip 升级,命令是:
python -m pip install --upgrade pip
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安装cutadapt的命令:
python -m pip install --user --upgrade cutadapt
下图运行结果提示缺少C++和wheel
在以下帖子里找到了解决方案,也就是需要在提到的网址中去下载和安装visual studio
https://github.com/pydata/bottleneck/issues/281
具体安装步骤我给截下来了,如下图
安装过程中发现了c++生成工具(如下图),和程序结果图中所述一致,立即选择安装。
终于安装成功了!!
注意:结果提示最好添加变量环境
C:\Users\xll\AppData\Roaming\Python\Python38\Scripts
方法如下:
https://jingyan.baidu.com/article/47a29f24610740c0142399ea.html
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尾巴
后续的dada2运行程序也终于成功了,这个下回再分解。
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