php生成分子式,php 转化smiles为分子式

近来在使用PHP进行结构式搜索的时候，发现获取到smiles无法进行查询操作，然后想到了转化为分子式的操作。主要是用在有机物。

困难一：我在smiles 上利用正则匹配C,O。遇到了问题就是其他元素也有C字母，所以无法正确去掉C

解决：我只用原来的smiles来分析有机物的组成，然后我按照有机物的结构，单独找出来C,O的数量，其余元素，简单统计一下放在后面就好了。主要分为三部分，C数目，O数目,其他元素

实现;1.前台获取的smiles，符合相应的规则

2.php处理

$Cnum=‘‘;

$Onum=‘‘;

//print($smiles."原来的");

$find=array("=","#",".","1","[","]","(",")");

$replace = array("");

$smiles=str_replace($find,$replace,$smiles,$j);

//print($j);

//ECHO ‘/n‘;

$ChemElement= array("Li","Be","Na","Mg","Al","Si","Cl","Br","Ca","Cr","Mn","Fe","Co","Ni","Cu","Zn","Ga","Gc","Ag","Au");

foreach($ChemElement as $value){

//print($value);

$k_x=substr_count($smiles,$value);

if($k_x>0){

$k_x=$k_x==1?‘‘:$k_x;

//str_replace($value,‘‘,$smiles);

$smiles_new.=$value.$k_x;

}

$k_c=substr_count($smiles,‘C‘);

//print(‘C个数‘.$k_c);

$i_c=preg_match_all(‘/C[a-z]/m‘,$smiles);

//print(‘非碳个数‘.$i_c);

$j_c=$k_c-$i_c;

//print_r(‘碳个数‘.$j_c);

//$smiles=preg_replace(‘/C[0-9A-Z/.]/m‘,‘‘,$smiles,-1,$count);

//print($smiles);

//print(‘替换次数‘.$count);

$k_o=substr_count($smiles,‘O‘);

//print(‘O个数‘.$k_o);

$i_o=preg_match_all(‘/O[a-z]/m‘,$smiles);

//print(‘非氧个数‘.$i_o);

$j_o=$k_o-$i_o;

//$smiles=preg_replace(‘/C[0-9A-Z/.]/m‘,‘‘,$smiles,-1,$count);

//print($smiles);

//print(‘替换次数‘.$count);

if($j_c>0){$j_c=$j_c==1?‘‘:$j_c;$Cnum=‘C‘.$j_c;}

if($j_o>0){$j_o=$j_o==1?‘‘:$j_o;$Onum=‘O‘.$j_o;}

$smilesPara = $Cnum.$Onum.$smiles_new;

结果：基本上可以解决一般意义上的分子式，当然元素我没有写全，我认为常用的写一下就好，本来就是为了搜索，不常见的物质，化学品库里也没有。

这里推荐一下斯芬克斯的PHP搜索引擎，很不错。

原文：http://10725691.blog.51cto.com/10715691/1940277

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