CentOS 8.5下安装R语言经验总结

作为一个linux与R语言的菜鸟新手，在安装R语言时问题百出，花了很长时间才安装好，下面讲安装的过程总结一下，希望对自己以及他人的安装有所帮助，其中引用了其他人的劳动成果，没办法，谁让自己是个菜鸟呢？废话不多说，开始安装。
1.在安装好CentOS 8.5之后，需要下载R语言所需要的环境包，但是CentOS官方在2022年的时候就停止了对centos8所有软件包的支持，所以，我们需要去改变它的下载库，解决方法
将下载源更换为阿里源等镜像源，可以具体搜索操作步骤：

[root@localhost yum.repos.d]# cd /etc/yum.repos.d/
[root@localhost yum.repos.d]# ls
CentOS-Linux-AppStream.repo          CentOS-Linux-Debuginfo.repo  CentOS-Linux-FastTrack.repo         CentOS-Linux-Plus.repo
CentOS-Linux-BaseOS.repo             CentOS-Linux-Devel.repo      CentOS-Linux-HighAvailability.repo  CentOS-Linux-PowerTools.repo
CentOS-Linux-ContinuousRelease.repo  CentOS-Linux-Extras.repo     CentOS-Linux-Media.repo             CentOS-Linux-Sources.repo

更改CentOS-Linux-AppStream.repo，CentOS-Linux-BaseOS.repo，CentOS-Linux-Extras.repo。具体方法是vim CentOS-Linux-AppStream.repo，将原先的mirrorlist注释掉，然后加入一个新的baseurl=https://mirrors.aliyun.com/centos/$releasever-stream/AppStream/$basearch/os/ 。
另外CentOS-Linux-BaseOS.repo，CentOS-Linux-Extras.repo也是同样的操作，只是将baseurl中的AppStream更换成对应的BaseOS和Extras而已。但是我改了之后发现无法连接，不知道是我输入有问题还是网址失效。
我用另外的方法解决了，实际上也是改变下载库，直接运行命令
sed -i -e "s|#baseurl=http://mirror.centos.org|baseurl=http://vault.centos.org|g" /etc/yum.repos.d/CentOS-*

原文链接：https://blog.csdn.net/weixin_42603182/article/details/122955181。
2.更换了下载库之后，需要下载R语言所需要的环境包，具体参考一下两篇博文：
https://blog.csdn.net/qq_27390023/article/details/124005660
https://blog.csdn.net/tandelin/article/details/118393753

mkdir -p /home/software/R
cd /home/software/R
yum -y install gcc
yum -y install glibc-headers
yum -y install gcc-c++
yum -y install gcc-gfortran
yum -y install bzip2-devel
yum -y install glibc-headers
yum -y install readline-devel
yum -y install libXt-devel
yum -y install zlib zlib-devel openssl openssl-devel pcre pcre-devel #可以分开安装，一起安装通容易出错
yum -y install mesa-libGLU mesa-libGLU-devel
yum -y install xz-devel.x86_64
yum -y install libcurl
yum -y install libcurl-devel
yum -y install texlive

这些包可能有重复的，但为了保险起见，我全部执行了一遍。
另外，在安装R语言的过程中通常会出现一个错误：configure: error: libcurl ＞= 7.28.0 library and headers are required with support for https。为了预防出现这样的问题，直接下载重装一下该包：

wget http://curl.haxx.se/download/curl-7.50.1.tar.gz
tar zxvf  curl-7.50.1.tar.gz
cd curl-7.50.1
./configure  --prefix=/opt/curl-7.50.1
make && make install

3.然后开始下载并安装R

cd /home/software/R
wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/src/base/R-4/R-4.1.3.tar.gz
tar -zxvf R-4.1.3.tar.gz
cd R-4.1.3
./configure --prefix=/opt/R-4.1.3   --enable-R-shlib
make
make install

至此R语言安装完成
但是运行R语言需要指出绝对路径

/home/software/R/R-4.1.3/bin/R/home/software/R/R-4.1.3/bin/Rscript# 相对路径
bin/R
bin/Rscript

4.如果为了方便可以更改配置文件中的环境变量，具体可以参考如下博文：
https://blog.csdn.net/weixin_40392053/article/details/120305760
方法一暂时生效

export PATH=$PATH:/home/software/R/R-4.1.3/bin

方法二（只对当前登陆用户生效，永久生效）
找到 .bash_profile 文件的路径

[root@localhost home]# locate bash_profile
/etc/skel/.bash_profile
/home/wolf/.bash_profile
/root/.bash_profile

进入配置文件

vim ~/.bash_profile

# .bash_profile# Get the aliases and functions
if [ -f ~/.bashrc ]; then. ~/.bashrc
fi# User specific environment and startup programsPATH=$PATH:$HOME/bin:/home/software/R/R-4.1.3/binexport PATH
~
~
"~/.bash_profile" 12L, 176C

在PATH=$PATH:$HOME/bin后面加：:/home/software/R/R-4.1.3/bin

PATH=$PATH:/home/software/R/R-4.1.3/bin

保存后，执行 source ~/.bash_profile 使其生效，

source ~/.bash_profile

由于设置的是当前用户目录下的 .bash_profile 文件
所以只对当前登陆用户生效，永久生效

方法三（对所有系统用户生效，永久生效）
修改 /etc/profile 文件，在文件末尾加上如下两行代码

PATH=$PATH:/home/software/R/R-4.1.3/bin
export PATH

然后source /etc/profile
具体参考:https://blog.csdn.net/weixin_40392053/article/details/120305760

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