2021年8月2日,JGG在线发表了中国中医科学院黄璐琦院士团队和中国科学院遗传与发育生物学研究所刘永鑫高级工程师合作题为“EVenn: Easy to create repeatable and editable Venn diagrams and Venn networks online”的研究论文。该论文介绍了一款用于数据交互性探索和可视化的一站式Venn图和Venn网络在线绘制平台

https://doi.org/10.1016/j.jgg.2021.07.007

自1880年首次提出以来,Venn图被广泛用于分析和展示多组数据集的交集、并集和差集的关系。当数据集小于5组时,经典的Venn图或Euler图呈现数据小巧美观,表意清晰 (图A, B, C)。当数据集增多时,UpSet图或Flower图则更适合数据展示 (图D, E)。除Venn图外,Venn网络可在呈现集合交并关系时清楚地展示每个特征,并且可以通过调整网络布局,更好地呈现数据集内部的复杂关系 (图F)。

Evenn 绘制Venn图和Venn网络示例

该研究开发出的EVenn可以通过一次性输入数据,3分钟内完成上述5种Venn图和Venn网络的绘制,特别适合整合数据集的探索分析和比较可视化。同时EVenn还提供了3种统计分析方法 (Fisher’s exact test, random sample test, Jaccard similarity test) 用于评估2个集合的相似性,并可以计算任意组数据的交并关系,对于关键基因或菌群的筛选更加便捷有效。

从2021年3月末有统计以来,Evenn共有1万多独立IP访问,日均使用百次。同时该网站配有详细的演示数据、图文操作教程和视频教程,为科研工作者提供了有力的数据统计支持。EVenn的访问网址:http://www.ehbio.com/test/venn/。

中国中医科学院中药资源中心陈同博士为论文第一作者,黄璐琦院士和刘永鑫高级工程师为该论文共同通讯作者。相关工作得到中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金资助。

使用此工具,引文如下:

Tong Chen, Haiyan Zhang, Yu Liu, Yong-Xin Liu, Luqi Huang. (2021). EVenn: Easy to create repeatable and editable Venn diagrams and Venn networks online. Journal of Genetics and Genomics doi: https://doi.org/10.1016/j.jgg.2021.07.007

猜你喜欢

10000+:菌群分析 宝宝与猫狗 梅毒狂想曲 提DNA发Nature Cell专刊 肠道指挥大脑

系列教程:微生物组入门 Biostar 微生物组  宏基因组

专业技能:学术图表 高分文章 生信宝典 不可或缺的人

一文读懂:宏基因组 寄生虫益处 进化树

必备技能:提问 搜索  Endnote

文献阅读 热心肠 SemanticScholar Geenmedical

扩增子分析:图表解读 分析流程 统计绘图

16S功能预测   PICRUSt  FAPROTAX  Bugbase Tax4Fun

在线工具:16S预测培养基 生信绘图

科研经验:云笔记  云协作 公众号

编程模板: Shell  R Perl

生物科普:  肠道细菌 人体上的生命 生命大跃进  细胞暗战 人体奥秘

写在后面

为鼓励读者交流、快速解决科研困难,我们建立了“宏基因组”专业讨论群,目前己有国内外5000+ 一线科研人员加入。参与讨论,获得专业解答,欢迎分享此文至朋友圈,并扫码加主编好友带你入群,务必备注“姓名-单位-研究方向-职称/年级”。PI请明示身份,另有海内外微生物相关PI群供大佬合作交流。技术问题寻求帮助,首先阅读《如何优雅的提问》学习解决问题思路,仍未解决群内讨论,问题不私聊,帮助同行。

学习16S扩增子、宏基因组科研思路和分析实战,关注“宏基因组”

点击阅读原文,跳转最新文章目录阅读

JGG | EVenn: 3分钟在线轻松绘制5种Venn图和Venn网络相关推荐

  1. 轻松绘制用户体验旅程图

    ⭐什么是用户体验旅程图 ✅定义:用户旅程图(Customer Journey Map)是将一个人为了完成某个目标(购买物品.收听内容.分享内容等)而经历的过程可视化的一种工具. ✅用户体验旅程图通常包 ...

  2. Volcano plot | 别再问我这为什么是火山图 (在线轻松绘制)

    封面来源于:Pixabay+易生信 生物信息学习的正确姿势 NGS系列文章包括NGS基础.高颜值在线绘图和分析.转录组分析 (Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这).ChIP-se ...

  3. 在线轻松绘制配对连线箱线图

  4. Python可视化神器:pyecharts,轻松绘制 30+ 种超实用精美图表!

    欢迎关注 ,专注 Python.数据分析.数据挖掘.好玩工具! 如果要问:Python 中有那些可视化工具库?我想很多人都能想起来 matplotlib,这是一款初学者绕不开的库,但随着对数据可视化的 ...

  5. python画k线图_使用Matplotlib轻松绘制股票K线图

    K线图是看懂股票走势的最基本知识,K线分为阴线和阳线,阴线和阳线都包含了最低价.开盘价.最高价和收盘价,一般的K线如下图所示: 度娘说:K线图源于日本德川幕府时代(1603-1867年),被当时日本米 ...

  6. python画资本市场线_使用matplotlib轻松绘制股票K线图

    K线图是看懂股票走势的最基本知识,K线分为阴线和阳线,阴线和阳线都包含了最低价.开盘价.最高价和收盘价,一般都K线如下图所示: 度娘说:K线图源于日本德川幕府时代(1603-1867年),被当时日本米 ...

  7. 【Python】pandas一行代码绘制26种美图

    本文目录 1.单组折线图 2.多组折线图 3.单组条形图 4.多组条形图 5.堆积条形图 6.水平堆积条形图 7.直方图 8.分面直方图 9.箱图 10.面积图 11.堆积面积图 12.散点图 13. ...

  8. graphpad prism怎么添加图例_如何用Graphpad Prism绘制两种堆叠图?

    打开软件后,通过双击窗口灰色区域或点Prism(棱镜)的小三角,新建工程文件.在弹出的向导窗口选择表格类型为Grouped,如下图. 将数据复制粘贴到Prism的表格中,接下来需要对数据矩阵做转置,点 ...

  9. pandas一行代码绘制26种美图

    ↑↑↑关注后"星标"简说Python 人人都可以简单入门Python.爬虫.数据分析 简说Python推荐 来源:pythonic生物人作者:pythonic生物人 本文目录 1. ...

最新文章

  1. mysql主从复制的简单配置
  2. PATA1001A+BFormat
  3. php查询字段的总和,ThinkPHP 多表查询-如其字段A相同,则把字段B相加
  4. 2019年4月第四周_2012年4月最佳怪胎文章
  5. redis——发布和订阅
  6. 安卓安装包不能覆盖原安装包_LOL手游全网最简单注册,安装教程,安卓 IOS皆可登录!攻略群有游戏安装包!...
  7. 董付国老师《Python程序设计基础》完美落幕
  8. 【架构师面试题库1】—etcd高可用集群搭建
  9. dfs-Bit Compression
  10. centos mysql压缩文件直接恢复_CentOS下利用mysqlbinlog恢复MySQL数据库
  11. STM32 HAL SPI读取MPU6500的设备ID异常
  12. 利用FinalData恢复shift+delete误删的文件
  13. 实践教程 | 万字长文,值得收藏/参考的OpenCV C++基础代码
  14. 基于图像的三维模型重建 ——双视角SFM
  15. transform改变图片大小以及位置
  16. pandas DatetimeIndex indexing
  17. Windows分盘,c盘已经满了,但d盘还有内存。
  18. 混合IT的新世界 存储工程师的江湖地位不保?
  19. 万向区块链行业研究:如果从用户画像实现角度看数据隐私问题,是怎样的?
  20. python 创建虚拟环境时报错OSError, setuptools下载失败

热门文章

  1. 我在迷你控制台风行一时
  2. [和平之月系列] 《都 Ancient City Ⅱ》 钢琴
  3. java jframe 切换_java – 在JFrame中切换面板
  4. 168元 vsol 2.5G ONU光猫V2802RH G800-04G 修改GPON SN
  5. 深入浅出的解释什么是IP地址、子网掩码、端口号、DNS、网关(初学者一定要看看)
  6. nginx中配置gzip_static on提示nginx: [emerg] unknown directive “gzip_static“ in
  7. Java后端开发技术栈
  8. html 数据交互动画,纯css实现可交互的动画
  9. 初始化mysql5.7.18_MySQL5.7.18,初始化完成登录,提示密码过
  10. 初识vue-baidu-map