rstudio 修改代码间距_Windows电脑使用Rstudio会有多少错误呢
本来以为给参加 生信技能树(爆款入门培训课) 的学员们安排,指导做完了 http://www.bio-info-trainee.com/3727.html 准备工作,上课就问题不大。
实际情况是,每次都会发现一些很有意思的小问题,主要是计算机相关设置问题。
首先是R包下载很慢的问题
这个需要批评了,我在周末班准备工作里面写的很清楚,切换镜像,如下,可以下载任何包
rm(list = ls()) options()$repos options()$BioC_mirroroptions(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))options()$repos options()$BioC_mirror
# https://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/GEOquery.htmlif (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("BiocManager")BiocManager::install("KEGG.db",ask = F,update = F)
如果压根就下载不了,可能是网络的问题,或者是下载设置的问题,包括http和https的区别,下载协议的区别。
然后强调一下,新手请务必经常通过下面这样点击rproj文件方式来打开自己的电脑的Rstudio。
打开R脚本的中文乱码问题
很多初学者友好型代码里面都是有中文注释的,所以大家拿到这样的代码然后使用自己的电脑的Rstudio打开就会不小心看到乱码,当然是有解决方案的。
之所以有乱码其实是因为Rstudio开发者及其公司都是欧美人,英文为主,对中文的友好度没那么强,我一直在思考,会不会泰文和印度语那边的学生使用Rstudio会更麻烦,有机会去泰国一定要去他们网吧试试看这个Rstudio好用不。
设置RStudio文本显示的默认编码
其实就是4个步骤:
RStudio菜单栏的Tools -> Global Options
在配置界面选择code下面的saving的 默认编码格式
在弹出的编码中,选择UTF-8编码。
点击OK,然后再点击OK,保存设置。
最后,在打开R代码文件的时候,选择File -> Reopen with encoding菜单,就可以选择我们使用UTF-8编码打开文件,这样子就可以正确地显示中文了。
R绘图失败
主要是因为不少人的Windows电脑用户名是中文,所以使用Rstudio会出现奇奇怪怪的错误。深层次原因是Rstudio在运行的时候会创建一些临时文件,这些临时文件默认是放在你的C盘里用户名下的一个文件夹里,由你电脑里面的TEMP这个环境变量指定。需要修改它, 比如修改为D盘。
首先查看环境变量,先点击控制面板
里面的高级系统设置
然后在高级
里面寻找环境变量
按钮如下:修改后如下:
这样问题就解决啦。
R下载包失败
首先看看电脑是否联网,然后看看R能否真的能够下载数据,测试代码download.file
进行文件下载:
download.file(url = "http://www.bio-info-trainee.com/wp-content/uploads/2019/02/heatmap.jpg", destfile = "heatmap.jpg")
发现无法直接下载内容,证明R在连接网络时出现了问题,需要修改R访问网络的方法为libcurl
, 代码如下:
options(download.file.method="libcurl")
GEOquery下载数据失败
以前在菜鸟团写过教程:GEOquery包的getGEO函数总是无法下载肿么办 不再赘述。
GEOquery下载表达矩阵缺样本名
以前在菜鸟团写过教程:要读源代码才能解决的报错-GEOquery下载表达矩阵缺样本名 不再赘述。
最后一个小广告
如果你觉得我推文信息量太大,而且有点简略,我们也有视频指导大家如何克服这些报错, 发布在B站,链接直达:https://www.bilibili.com/video/av26077409 (请自行复制粘贴此链接去浏览器打开)
当然,如果你迫不及待想了解更多生信必修课之软件安装的课程,也可以直接购买学习,链接是:https://ke.qq.com/course/310838 (文末
rstudio 修改代码间距_Windows电脑使用Rstudio会有多少错误呢相关推荐
- rstudio 修改代码间距_如何在RStudio里修改R脚本的编码方式
展开全部 具体: 1.sp_helpsort SELECT SERVERPROPERTY ('Collation') 查看排序规则. 应该字符集关. 2.更改服务器排序规则 更改 SQL Server ...
- rstudio 修改代码间距_第一章 R和RStudio
R与RStudio R是一种统计学编程语言,在科学计算领域非常流行.它是由Ross Ihaka和Robert Gentleman开发的,是 "S "编程语言的开源实现.R也是使用这 ...
- rstudio 修改代码间距_R语言入门:使用RStudio的基本操作
R语言在人工智能,统计学,机器学习,量化投资,以及生物信息学方面有着十分广泛的运用.也是我大学的必修课,因此这里梳理一些有关R语言的知识点,做做记录. 首先我们需要知道R语言的工作区域,R语言默认的工 ...
- 【译文】使用Rstudio调试代码(debug)
作者 Jonathan McPherson 译者 钱亦欣 引言 在R语言中dubug是个广泛讨论的话题,本文将聚焦于Rstudio内集成的debug工具.如果你想了解更多这个领域的内容,请参考下面这篇 ...
- jz2440开发板移植U-boot之修改代码支持DM9000网卡
今天我们来移植U-boot到jz2440开发板,修改代码支持DM9000网卡.查看之前写的移植记录请点击链接:点击查看之前的移植记录 现在大多数开发板都支持DM9000网卡.我们的U-boot源码里面 ...
- 用yolo3训练自己的数据集(包含数据搜集,图片标注,图片批量命名以及如何修改代码)——口罩佩戴以及规范佩戴口罩检验
用yolo3训练自己的数据集--口罩佩戴及规范性佩戴检验 前言 1. 数据集处理 1.1 数据搜集(多途径) 1.2 自己制作数据集 2.图片标注 2.1 图片批量命名 2.2 使用labelimg进 ...
- R语言图形编辑器GUI开发环境RStudio安装(Windows操作系统下、RStudio开发环境安装)
R语言图形编辑器GUI开发环境RStudio安装(Windows操作系统下.RStudio开发环境安装) RStudio是R语言的集成开发环境(IDE),它是一个独立的开源项目,它将许多功能强大的编程 ...
- 【Typora主题设置】Typora如果修改代码块样式
Typora软件样式修改介绍 介绍Typora软件编辑样式步骤 找到安装的typora主题文件路径,打开"文件--偏好设置--外观--打开主题文件夹",如下图: 2. 进入Typo ...
- 将爱心代码设为电脑屏保,俘获少女芳心,还能假装黑客大佬,在酷炫的界面中保护隐私
将爱心代码设为电脑屏保,俘获少女芳心,还能假装黑客大佬,在酷炫的界面中保护隐私 本文介绍 Hacker Screen Saver 一款开源 Windows 屏保的使用.Hacker Screen Sa ...
最新文章
- 如何优雅地训练大型模型?
- 1.5亿美元!英国AI芯片创企今宣布获新融资,估值近20亿美元
- mycncart 1.4.0.0 新版本发布
- numpy 笔记:finfo
- C语言结构-演员请就位
- Nacos配置中心-加载多配置集
- 博客堂joycode被黑掉了
- Boost Asio Work类
- Ubuntu无法安装Xmind rpm包
- robotframe处理日志中文问题
- 零基础学UI设计教程之图标的设计形式讲解
- 操作系统测试题(第1,2单元)
- 抑郁症自我测试皮肤软件,以躯体症状为主的抑郁症患者的交感神经皮肤反应研究...
- 2021全球程序员收入报告!字节高级码农年薪274万元排第5
- 中专计算机基础知识汇总,【职业中专计算机基础教育分析】 计算机基础知识...
- H3C服务器配置raid
- 区块链学习者终极指南
- C语言初学知识准备(Linux方面)
- Linux 下实现虚拟专用网(PPTP)
- jenkins 报错 code=exited, status=127