在MySQL中note是什么意思_在Jupyter noteb中从MySQL中检索巨大的数据表
我正在尝试使用Jupyter笔记本从MySQL表中获取1亿行。我尝试过使用pymysql.cursors来打开MySQL连接。实际上,为了加快查询选择过程,我尝试过使用批处理,因为要同时选择所有行是一个非常繁重的操作。以下是我的测试:import pymysql.cursors
# Connect to the database
connection = pymysql.connect(host='XXX',
user='XXX',
password='XXX',
db='XXX',
charset='utf8mb4',
cursorclass=pymysql.cursors.DictCursor)
try:
with connection.cursor() as cursor:
print(cursor.execute("SELECT count(*) FROM `table`"))
count = cursor.fetchone()[0]
batch_size = 50
for offset in xrange(0, count, batch_size):
cursor.execute(
"SELECT * FROM `table` LIMIT %s OFFSET %s",
(batch_size, offset))
for row in cursor:
print(row)
finally:
connection.close()
目前测试应该只打印出每一行(或多或少不太值得),但我认为最好的解决方案是将所有内容存储在pandas数据框中。
不幸的是,当我运行它时,我得到了这个错误:KeyError Traceback (most recent call
last) in ()print(cursor.execute("SELECT count(*) FROM `table`"))
---> count = cursor.fetchone()[0]batch_size = 50
KeyError: 0
有人知道会出什么问题吗?
也许使用chunksize是个更好的主意?
提前谢谢!在
更新
我再次重写了代码,没有批处理大小,并将查询结果存储在pandas数据帧中。最后,它似乎在运行,但由于数据量为100mln行,因此执行时间看起来几乎是“无限的”:
^{pr2}$
加快这一进程的正确方法是什么?可能通过传递参数chunksize = 250?
而且如果我试图打印df的类型,那么它输出的是一个生成器。实际上,这个不是一个数据帧。在
如果我打印df,输出是:
如何获取数据帧格式的数据?因为如果我打印fetch_all命令,我可以看到查询的正确输出选择,因此在这一点上,一切都按预期工作。在
如果我试图将Dataframe()与fetchAll命令的结果一起使用,我会得到:ValueError: DataFrame constructor not properly called!
另一个更新
我可以通过如下方式迭代pd.read_sql输出结果:for chunk in pd.read_sql(query, connection, chunksize = 250):
chunks.append(chunk)
result = pd.concat(chunks, ignore_index=True)
print(type(result))
#print(result)
最后我得到了一个名为result的数据帧。在
现在的问题是:是否可以无限制地查询所有数据?在
究竟是什么影响了流程基准?在
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