cytoscape使用方法_Cytoscape使用方法
提供领先的基因组学解决方案
Providing advanced genomic solutions
Cytoscape Quick Start
1.
安装
JDK1.6
32
位下载地址:
http://javadl.sun.com/webapps/download/AutoDL?BundleId=83383
64
位下载地址:
http://javadl.sun.com/webapps/download/AutoDL?BundleId=83385
2.
安装
Cytoscape2.8.3
下载下址:
http://www.cytoscape.org/download.html
3.
打开
Cytoscape
软件,根据菜单导入
*.ppi.txt
文件数据:
File
—
> Import
—
> import network from table
(
Text/MS Excel
)会弹出导入文件的对话框,
在对话框中做设置如下:
(
1
)
Input file:
选择文件路径
(
2
)
Source interaction: column 1
(
3
)
Target interaction: column 2
(
4
)
Preview:
单击
column 3
,此列会变绿,说明此列已可用
(
5
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