15天入门生物信息(2021年)15天入门生物信息(2021年)_哔哩哔哩_bilibili

atha.fasta的前10行  打印出来

head -n 10 atha.fasta

atha.fasta的前10行  放到一个文件里面    重定向

head -n 10 atha.fasta>head10.fasta

查看里面的内容   10行  10个字符(一个单词)698字符

wc head10.fasta

cat head10.fasta

cat head10.fasta|wc -l

cat head10.fasta|wc 

 后10行  覆盖原来的          (一个>号)

tail -n 10 atha.fasta>head10.fasta          

wc head10.fasta

cat head10.fasta

 后10行  追加原来的   两倍重复        (两个个>>号)   20行

提取 atha.gff 的 400- ک 500行,打印输出到subset.gff

(一)head -n 500 atha.gff> temp.gff


tail -n 101 temp.gff>subset.gff

rm temp.gff

(二)管道 |     不要中间 (水桶)

head -n 500 atha.gff | tail -n 101 temp.gff>subset.gff

查看፡ atha.fasta 有多少条序列

less -S atha.fasta              内容

grep ">" atha.fasta      所有包含>的行   筛选出来

grep ">" atha.fasta   |wc                          统计 wc命令

grep -c ">" atha.fasta                                  grep命令

检查大豆中的基因 是否有重复,若果有,把重复的拿出来

ls -l *fasta                     所有的fasta文件

ls -l  -h *fasta   

grep ">" gmax.fasta|less         拿到  交给less,打开  这个命令的输出

grep ">" gmax.fasta|sort   |uniq |wc              去重复

grep ">" gmax.fasta|wc                                 没有去重复  

基因课 15天入门生物信息(2021年) 第三天 Linux基础命令(3)相关推荐

  1. 基因课 15天入门生物信息(2021年) 第三天 Linux基础命令(2)

    查看文件10行 head atha.gff head atha.fasta  head atha.fasta tail  atha.fasta  head  -n 3   atha.gff      ...

  2. 基因课 15天入门生物信息(2021年) 第三天 Linux基础命令(1)

    ls ls -l ls -l -h                                             显示文件大小     单位K  M  G ls -lh ls -lh  rn ...

  3. Linux 基础命令快速入门

    Linux 基础命令快速入门: 目录 Linux 基础命令快速入门: 1.vim 命令记录 2.开机.重启和用户登录注销 3.用户管理 4.用户组相关 5.用户信息文件 6.实用指令 7.帮助指令 8 ...

  4. Linux(Ubuntu)入门——2.Linux基础命令

    Linux(Ubuntu)入门--2.Linux基础命令 目录 Linux基础命令 Linux系统主要目录及其内容 Linux基础命令 sudo su root -- 切换至root用户 su xx ...

  5. Linux 基础命令入门 文件压缩

    Linux 基础命令入门 文件压缩 一般 tar-zcvf压缩文件分两个步骤: 第一步骤,把要压缩的文件整成一个包 testtar.txt.tar 第二步骤,把打成包的文件压缩,testtar.txt ...

  6. 生物信息入门之 linux,手把手教你学生信系列(三)-- Linux 基础入门拦路虎

    原本计划这一篇介绍基础命令的,然后我们微课学院之前已经有相关录制好的视频,而且网上的相关文章多不胜数,因此也就不在卖弄了,简单交流一下 Linux 入门过程中的几个拦路虎,具体命令等在后文具体与到时候 ...

  7. linux结束所有任务命令行,Linux基础命令(15)定时任务

    释放双眼,带上耳机,听听看~! crontad Linux定时任务Crontab命令详解 linux 系统则是由 cron (crond) 这个系统服务来控制的.Linux 系统上面原本就有非常多的计 ...

  8. linux常用命令大全(linux基础命令入门到精通+实例讲解+持续更新+命令备忘录+面试复习)

    前言 本文特点 授之以渔:了解命令学习方法.用途:不再死记硬背,拒绝漫无目的: 准确无误:所有命令执行通过(环境为centos7),拒绝复制粘贴: 实用性高:命令多为实际工作中用到的,实例讲解,拒绝纯 ...

  9. Linux基础命令入门

    1.目录结构详解 目录 详细 /bin 存放二进制可执行文件(ls,cat,mkdir等),常用命令一般都在这里. /etc 存放系统管理和配置文件 /home 存放所有用户文件的根目录,是用户主目录 ...

最新文章

  1. Retrofit 网络请求参数注解@Path @Field @Query 等使用
  2. 中文 查询_查询商标,商标注册通过分析的几个小技巧
  3. python中notebook_Jupyter Notebook--学习python必不可少的工具
  4. return error怎么定义_自定义一个注解校验接口参数
  5. SYSENTER——快速系统调用
  6. CF666E-Forensic Examination【广义SAM,线段树合并】
  7. 君威u0073故障码解决_顽疾修复过程,君威没倒挡的变速箱故障就是这样修好
  8. LeetCode 1073. 负二进制数相加(负数进制)
  9. 基于DDD的.NET开发框架 - ABP依赖注入
  10. [bzoj1925][Sdoi2010]地精部落
  11. webpack 报错 path is not defind
  12. 利用poi开源jar包操作Excel时删除行内容与直接删除行的区别
  13. 剑指offer面试题[49]-把字符串转化为整型
  14. Android对话框的高级设置《二》设置对话框按钮的透明度和对话框的在屏幕上的显示位置
  15. c语言入门经典+第5版+习题答案,《C语言入门经典(第5版)》—甲虎网一站式图书批发平台...
  16. 单片机毕业设计 超声波雷达可视化系统
  17. 获得客户端真实IP的方法
  18. Python进行Excel数据处理
  19. CAD electrical简易教程(一)
  20. 一般试卷的纸张大小是多少_试卷字体多大合适 标准试卷的字体大小

热门文章

  1. 实践教程|如何用YOLOX训练自己的数据集?
  2. 如何改进YOLOv3使其更好应用到小目标检测(比YOLO V4高出4%)
  3. 一个超干货的3D视觉学习社区
  4. VS2013+OpenCV3.1.0配置教程
  5. SpringBoot 拦截器和过滤器
  6. vc++中几个常用的数学函数
  7. OpenCV简介与安装
  8. 【错误归纳】selenium.common.exceptions.WebDriverException: Message: unknown error
  9. Android 的权限级别小记
  10. CLASSPATH的作用