DeepChem | DeepChem的图卷积特征化器
DeepChem
官网:https://deepchem.io/
DeepChem旨在提供高质量的开源工具链,将药物开发、材料科学、量子化学和生物学方面的深度学习应用普及化。
DeepChem提供了几种用于图卷积的特征提取方法。探索对其中一种图形卷积Featurizer所做的事情。
运行环境
- CentOS 7
- Python3.6
- DeepChem2.2
导入库
import os
import pandas as pd
import numpy as np
from deepchem.models.tensorgraph.models.graph_models import GraphConvModel
import deepchem.feat.graph_features
from rdkit import Chem
from rdkit.Chem.Draw import IPythonConsole
from IPython.display import SVG
from rdkit.Chem import rdDepictor
from rdkit.Chem.Draw import rdMolDraw2D
载入数据
<
DeepChem | DeepChem的图卷积特征化器相关推荐
- 解读:基于图卷积特征的卷积神经网络的股票趋势预测(文末赠书)
写在前面 下面这篇文章的内容主要是来自2020年发表于Information Science 的一篇文章<A novel graph convolutional feature based co ...
- 【ML特征工程】第 8 章 :自动化特征化器:图像特征提取和深度学习
- 进一步认识Deepchem的分子特征化: 将化学分子结构作为到随机森林\CNN\RNN\GNN等机器学习模型输入的三种方法
'''by wufeil进一步认识分子特征化:将化学分子结构作为到随机森林\CNN\RNN\GNN等机器学习模型的输入如何将一个分子SMile表示的分子输入到机器学习/深度学习中呢?例如:CH3CH3 ...
- DeepChem | 基于图卷积预测分子的溶解度
如何使用DeepChem库将图卷积用于类似问题的回归分析. from deepchem.models.tensorgraph.layers import GraphPool, GraphGather ...
- 卷积神经网络系列之卷积/池化后特征图大小怎么计算??
1.卷积后的大小: W:矩阵宽,H:矩阵高,F:卷积核宽和高,P:padding(需要填充的0的个数),N:卷积核的个数,S:步长 width:卷积后输出矩阵的宽,height:卷积后输出矩阵的高 w ...
- 【卷积神经网络--卷积/池化后特征图大小计算公式】
[卷积神经网络–卷积/池化后特征图大小计算公式] 参考链接: 卷积神经网络系列之卷积/池化后特征图大小怎么计算?? torch中的Conv2d卷积的输入的Tensor张量是:[batch, chann ...
- ACKRec:注意力异构图卷积深度知识推荐器 SIGIR 2020
论文链接:http://keg.cs.tsinghua.edu.cn/jietang/publications/Sigir20-Gong-et-al-MOOC-concept-recommendati ...
- NIPS2020 | DiffGCN:利用微分算子和代数多重网格池化优化图卷积
今天给大家介绍以色列本·古里安大学的研究人员发表在NIPS2020上的一篇论文.图卷积网络(GCN)在处理无序数据(如点云和网格)方面已被证明是有效的方法,作者在有限差分和代数多重网格框架的启发下,提 ...
- k-阶特征交叉增强图卷积网络
<Cross-GCN: Enhancing Graph Convolutional Network with k-Order Feature Interactions>论文阅读笔记 何向南 ...
最新文章
- 中国人情世故的63个定律 。
- python编程有用吗-分享8点超级有用的Python编程建议
- linux nginx cdn,linux – Nginx Proxy_Pass到CDN与直接击中CDN. P...
- 服务器硬件及RAID配置
- 2006世界杯赛程表,不能错过:)
- nginx中文件路径表示方法
- dropdownlist三级联动怎么实现_一张表实现三级联动
- MYSQL GROUP BY 对多个字段进行分组
- cf #213 Matrix
- 获取IP及判断IP是否在区间
- IAR在写结构体时不提示_造价钢结构设计人神器:16个钢结构计算小软件,独立自动换算参数...
- 详细解析堆排序java实现
- android 清理大师 编程,清理大师 Android v2.3.3
- 为何恒星/太阳(辐射)可以被视为黑体(辐射)?
- Flink 容错恢复 2.0 2022 最新进展
- 基础C语言知识串串香10☞数组字符串结构体联合体枚举
- 公众号代运营的价格一般是多少钱
- SparkStreaming 实现广告计费系统中在线黑名单过滤实战
- 决胜未来,2019前端开发十大战略性技术布局
- 空调属于什么计算机系统,空调系统