在线作图丨如何绘制精美的3D饼图
Question 1:什么是饼图?
饼图(pie chart)是常用的基本统计图形之一,可以直观地展示整体与个体之间的比较情况。在生信分析中,饼图常用于展示各元素数值相对于总数的占比情况,图中每个扇区的半径是相等的,扇形面积大小表示该元素数值的占比大小。
Question 2:如何不利用R绘制2D或3D饼图?
小编和他的小伙伴们开发了一个在线的作图小网站——云图图(https://www.cloudtutu.com/#/index,免费的哦~),操作步骤如下:
①登录网址:https://www.cloudtutu.com/#/index(推荐使用360或者谷歌浏览器)
②输入用户名和密码(小编已经为大家填好了,如果不显示可添加文末二维码添加小编获取),输入验证码后即可登录,无需注册,直接使用,不必担心隐私泄露,是不是诚意满满~
③登录后在工具一栏(全部分析)里找到饼图,点击进入;
④请按照界面右侧的说明书或者下文进行操作,即可在2分钟内获得一张精美的2D或3D饼图。
step 1:上传文件
※目前平台仅支持.txt(制表符分隔)文本文件或者.csv文件的文件上传。(平台可对不规范的数据格式进行部分处理,但还是请您尽量按照示例数据的格式调整数据,以便机器可以识别)
a)准备一个数据矩阵(形式参照示例数据,如微生物物种丰度表、基因表达量矩阵、代谢物含量表,也可以是测量数据,例如身高、体重、表型等);
b)表格需要带表头和列名,每一列为样本名,每一行为各种指标数据名,例如OTU、ASV、基因ID、身高、代谢物名称等。
c)请提交txt(制表符分隔)文本文件或者.csv文件。操作方法为:全选excel中的所有内容(ctrl+A),复制到记事本中,将记事本文件另存后点击“上传”按钮上传该文件。
step 2:参数设置
2.1 绘图类型:常规、 3D
2.2 选择第几列样本:按需求选择想要绘制的样本(默认示例数据不能选择,可上传自己的数据选择)
#默认示例数据界面(暂无样本选择)
#自己的数据界面(上传自己的文件后即有样本选择)
2.3 绘制数量:绘制前多少个元素,剩余元素会合并成others展示
2.4 自定义标题:按需求自行设置
step 3:下载文件
点击“运行”开始作图,点击“下载”保存PDF格式的矢量图。PDF格式的文件可通过矢量图编辑工具进行编辑。
step 4:作图后处理
TUTU云平台提供的是PDF格式的矢量图,可通过矢量图处理软件进行编辑和调整(如:文字字体,文字大小,图片分辨率等)。图形处理软件和使用方法可扫描文后的二维码添加小编获取。
写作建议
XXXX was performed on Tutools platform (https://www.cloudtutu.com), a free online data analysis website.
尊敬的用户,如果图图云平台在您的科研中有幸提供了些许帮助,我们期望您能在方法学或者致谢中提及我们,引用方法如下:XXXX analysis was performed on Tutools platform (http://www.cloudtutu.com), a free online data analysis website. 目前平台还处于测试阶段,使用过程中有任何疑问或者报错欢迎随时联系小编反馈。您的反馈和建议是我们最大的动力。
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