引文:为了跑一篇论文的实验,需要装R软件,安装R软件参考之前发布的一篇博文:CentOS下搭建R环境,下面介绍怎么安装R**randomForest**和ROCR两个工具包。

1.R3+版本安装包

1.1 randomForest包

下载链接地址:

wget http://cran.at.r-project.org/src/contrib/Archive/randomForest/randomForest_4.6-7.tar.gz

在linux下无需解压,直接切换地址到下载的文件目录下,执行代码

R CMD INSTALL randomForest_4.6-7.tar.gz

1.2 ROCR包

ROCR依赖于gplots,所以要先安装gplots,而gplots依赖gtools,gdata,caTools,同时caTools还依赖bitops,所以安装顺序如下:
gtools下载
先下载各个工具包

wget http://cran.at.r-project.org/src/contrib/Archive/gtools/gtools_3.4.1.tar.gz
wget http://cran.at.r-project.org/src/contrib/Archive/gdata/gdata_2.13.3.tar.gz
wget http://cran.at.r-project.org/src/contrib/Archive/bitops/bitops_1.0-5.tar.gz
wget http://cran.at.r-project.org/src/contrib/Archive/caTools/caTools_1.17.tar.gz
wget http://cran.at.r-project.org/src/contrib/Archive/gplots/gplots_2.16.0.tar.gz
wget http://cran.at.r-project.org/src/contrib/Archive/ROCR/ROCR_1.0-6.tar.gz

接着按照依赖循序依次安装包

R CMD INSTALL gtools_3.4.1.tar.gz
R CMD INSTALL gdata_2.13.3.tar.gz
R CMD INSTALL bitops_1.0-5.tar.gz
R CMD INSTALL caTools_1.17.tar.gz
R CMD INSTALL gplots_2.16.0.tar.gz
R CMD INSTALL ROCR_1.0-6.tar.gz

如果你是R3+,到此可以结束了,已经安装完成。下面介绍R-2.10.1的安装和相应包的安装。

2.R-2.10.1版本及包的安装

2.1 下载R-2.10.1

wget -P ~/software/ http://mirror.bjtu.edu.cn/cran/src/base/R-2/R-2.10.1.tar.gz

-P是指定路径的。

2.2 安装R-2.10.1

tar -zxvf R-2.10.1.tar.gz
cd R-2.10.1/
./configure --prefix=/home/work/R --enable-R-shlib
meke
meke install

2.3 randomForest包安装

下载链接地址:

wget http://cran.at.r-project.org/src/contrib/Archive/randomForest/randomForest_4.6-7.tar.gz

在linux下无需解压,直接切换地址到下载的文件目录下,执行代码

R CMD INSTALL randomForest_4.6-7.tar.gz

2.4 ROCR包的安装

依赖关系上面已经给出来了,只是有的依赖包的版本有区别,下面给出下载地址和安装方法
下载各个包

wget http://cran.at.r-project.org/src/contrib/Archive/gtools/gtools_3.4.1.tar.gz
wget  http://cran.at.r-project.org/src/contrib/Archive/gdata/gdata_2.8.2.tar.gz
wget http://cran.at.r-project.org/src/contrib/Archive/bitops/bitops_1.0-5.tar.gz
wget http://cran.at.r-project.org/src/contrib/Archive/caTools/caTools_1.17.tar.gz
wget http://cran.at.r-project.org/src/contrib/Archive/gplots/gplots_2.8.0.tar.gz
wget  http://cran.at.r-project.org/src/contrib/Archive/ROCR/ROCR_1.0-3.tar.gz

安装

R CMD INSTALL gtools_3.4.1.tar.gz
R CMD INSTALL gdata_2.13.3.tar.gz
R CMD INSTALL bitops_1.0-5.tar.gz
R CMD INSTALL caTools_1.17.tar.gz
R CMD INSTALL gplots_2.16.0.tar.gz
R CMD INSTALL ROCR_1.0-6.tar.gz

OK!大功告成。

R语言-安装randomForest和ROCR包相关推荐

  1. R 语言 安装DESeq2,dplyr 包遇到报错的彻底解决方案

    一.问题 今天想使用 R 重新对数据进行差异表达分析,在安装DESeq2的时侯,遇到下面的报错: Error: package or namespace load failed for 'Genome ...

  2. R语言使用randomForest包构建随机森林模型(Random forests)、使用importance函数查看特征重要度、使用table函数计算混淆矩阵评估分类模型性能、包外错误估计OOB

    R语言使用randomForest包中的randomForest函数构建随机森林模型(Random forests).使用importance函数查看特征重要度.使用table函数计算混淆矩阵评估分类 ...

  3. R语言使用randomForest包构建随机森林模型的步骤和流程、随机森林算法包括抽样样本(观察)和变量来创建大量的决策树(多个树,构成了森林,而且通过样本抽样和变量抽样,让多个树尽量不同)

    R语言使用randomForest包中的randomForest函数构建随机森林模型的步骤和流程(Random forests).随机森林算法包括抽样样本(观察)和变量来创建大量的决策树(多个树,构成 ...

  4. R语言安装.tar.gz包

    R语言安装.tar.gz包 # 以ElemStatLearn包的安装为例 # "package 'ElemStatLearn' is not available for this versi ...

  5. R语言·文本挖掘︱Rwordseg/rJava两包的安装(安到吐血)

    每每以为攀得众山小,可.每每又切实来到起点,大牛们,缓缓脚步来俺笔记葩分享一下吧,please~ --------------------------- R语言·文本挖掘︱Rwordseg/rJava ...

  6. R语言安装一些包的一些常见问题及经验之谈的解决办法

    R语言解释器自带有一些系统包,对于大多数人来说够用了,但是这些基础包通常不能满足我们的需要,这时候就需要从互联网下载一些第三方或者官方包以满足我们的需要.不光是R语言,包括Python.Java.Ph ...

  7. R语言安装REmap包及安装baidumap报错问题和使用

    总结下R语言绘制地图热力图和交互行程距离图, 方法一 install_git("https://github.com/Lchiffon/REmap")library(REmap) ...

  8. R语言——安装程序包时找不到对象怎么办?

    R语言--安装程序包时找不到对象怎么办? 安装程序包lmtest,但是出现错误,找不到对象lmtest 给lmtest加上双引号,安装成功!注意是英文的双引号哦!

  9. R语言安装glmnet包

    R语言安装glmnet包 安装glmnet包 安装glmnet包 正常这样安装时报错 install.packages("glmnet") 改为如下代码可正常安装. install ...

最新文章

  1. 17秋 软件工程 第六次作业 Beta冲刺 总结博客
  2. 靠 GitHub 打赏谋生的程序员,他们是怎么做的?
  3. php如何加网址链接,怎么给一个PHP密码访问页面加超链接
  4. 记录更新(Java数据类)
  5. C# 操作MSSQL数据库类
  6. 小米投资偏爱智能与芯片 雷军:有3家科创板上市
  7. Feign自定义编程配置
  8. Myeclipse包变成文件夹
  9. 学了一年matlab,我到现在还不会读论文~
  10. Hadoop job任务分配
  11. matlab阶乘函数、排列组合函数、数组求和、未定义变量带入计算,简化结果值
  12. 计网实验二——以太帧、IP报文分析
  13. 判断四个点是否可以构成矩形(优雅的解法!!!)
  14. 电脑测网速c语言,C层实现多线程测网速
  15. 人力资源总监面试时是怎么想的?
  16. Python 可视化如何配色?这个工具你值得拥有
  17. beta阶段贡献分配实施
  18. asp 收集的资料了,为了方便查阅。
  19. 《子弹笔记术》读书笔记
  20. 打造高安全数字基础设施:中国电子云服务关键行业的宣言

热门文章

  1. 整理uc/os的46个函数
  2. 【2022】软件笔录日记
  3. centos查看php安装路径
  4. Word2003入门动画教程31:显示文档中的绘图网格
  5. KIW-AL10(全网通)线刷+卡刷 {救砖| 降级| 回官} 实用教程
  6. 硬件***检测系统完全导购
  7. IE浏览器PDF展示,禁止下载,禁止打印,禁止另存,禁止复制完美解决
  8. nginx反向代理下载文件失败处理
  9. Redis分片集群启动过程分析
  10. mysql给表改名_mysql重命名表