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LDSC分析基于已有的GWAS结果，即gwas summary数据，可以评估性状的遗传力，分析两个性状间的遗传相似度。相比GREML, 其运算速度快，更适用于处理大样本量的数据。

LD hub是一个网页版的工具，可以进行LDSC分析。同时也从各种开源数据库中收集整理了gwas summmary数据，分析了多种性状的遗传力和遗传相似度，对应的文献发表在Bioinformatics上，链接如下

https://academic.oup.com/bioinformatics/article/33/2/272/2525718

官网如下

http://ldsc.broadinstitute.org/

这个网站需要登录谷歌账号才可以使用，包含了一下3大功能模块

1. Test Center

这个模块用于上传自己的gwas结果，进行LDSC分析。首先上传数据

然后选择进行遗传相似度分析的性状

最后提交即可。

2. Lookup Center

检索数据库中已有的分析结果，包含了以下两种结果

1. SNP Heritability results

2. Genetic correlation results

单一性状SNP遗传力分析的结果示意如下

H2表示SNP遗传力，SE_H2表示SNP遗传力的标准误，Chi2表示平均的卡方值，Intercept表示回归方程的截距。

两两性状间遗传相似度的分析结果示意如下

rg表示遗传相似度genetic correlation，se表示遗传相似度的标准误。

3. GWAShare Center

该模块有以下两个功能

1. 查看已有的GWAS分析结果

2. 共享自己的GWAS分析结果

通过该网站，可以方便地进行LDSC的分析。

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