分析lammps文件_LAMMPS学习系列（24）

一个剪切（shear）模拟例子的学习（1）

自从前段时间给出了一个拉伸的例子后，一直有人留言问我剪切模拟方面的问题，很疑惑，在此声明一下，我没专门研究过力学方面的模拟，做拉伸只是爱好LAMMPS，试着做了下，不过模拟效果似乎还不错。既然很多人对shear模拟（希望我没弄错）感兴趣，那么我们今天开始聊一下这个模拟，正好LAMMPS的example文件里面给了一个shear模拟的例子（应该是开发LAMMPS软件的大牛写的，值得好好品味）：

先打开LAMMPS自带的example文件后进入其中的shear文件。

其中有两个in文件（in.shear/in.shear.void），这两个基本一样，只是其中一个的模型中含有一个空洞（void）随便打开一个先欣赏一下，其它的log文件可以不管。现在对in文件中的内容尝试性的解读一下（#后面为注释）：

units metal #定义体系的单位

boundary s s p #定义边界条件

atom_style atomic #定义原子类型

lattice fcc 3.52#定义晶格类型和晶格常数用于构建盒子

region box block 0 16.0 0 10.0 0 2.828427#划分模拟盒子区域

create_box 3 box #定义模拟盒子内所含的原子种类

lattice fcc 3.52 orientx 1 0 0 orient y 0 1 1 orient z 0 -1 1 & origin 0.5 0 0 #覆盖上一条lattice命令用于填充原子

create_atoms 1 box #先用类型为1的原子将盒子里面填满

关于建模这一块，新手还是感觉抽象的话，那就加一个dump命令先运行一下，然后去掉origin指令再运行一下，对比两次运行后得到的模型。包含origin指令时：

不包含origin指令时：

可以很明显的看到模型整体向x方向平移了0.5个晶格常数的距离

使用orgin的原因：按我分析，99%是因为定义了s类型的边界条件，建的模型边界原子需要这样处理一下。若是平时模拟shear模拟的时候感觉结果有问题话，可以在这个地方检查一下。 有兴趣的可以试试将s边界条件换成p看看构建后的模型是怎么样的，与s边界条件下的模型对比一下。

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