【空间单细胞组学】第2期:乳腺癌患者经anti-PD1治疗后,肿瘤内变化的单细胞图谱
这周的文献分享,jw给大家讲解了一篇和治疗相关的单细胞文献,内容为:乳腺癌患者经过anti-PD1治疗后,肿瘤内变化的单细胞图谱。
视频已同步到B站: 讲解很细致,大家可以移步B站学习。
下文结合jw的讲解和原文内容,简单介绍一下
背景
前期相关研究已经表明,乳腺癌患者接受免疫治疗后,整体上可以得到一定缓解和延长生存。尽管如此,还是有一部分人没有响应。
是否有一些潜在机制或者标志物可以预测治疗响应,显得十分重要,这也是这篇文章的目的。PD1、PD-L1、淋巴细胞浸润、TMB等等这些都是已知的标志物,此外T细胞克隆扩增也能预示着ICB的治疗响应。这篇文章也是以此为出发点展开的课题。
实验设计
取anti-PD1治疗前后的配对样本,同时进行scRNA-seq和scTCR-seq。根据T细胞的克隆型将病人分成了克隆扩增(E)和没有克隆扩增(NE)两组。
结果
文章的很多结果都是在治疗前/治疗后,E / NE这样的分组之间进行比较。 作者将同时具有激活、耗竭特征的T细胞命名为Tex cells(experienced T cells)。这类细胞有增殖特征,表达PD1分子,且E组比NE组更高。从细胞占比来看,这类细胞在E组也更多。
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这些数据表明:表达PD1的T细胞百分比和T细胞克隆扩增相关,在anti-PD1治疗后,CD8+和CD4+的Tex细胞是主要的扩增T细胞。
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拟时序分析发现,在naive T向CD8+ Tex细胞转变的路径后期,来自E组的Tex细胞比NE组更多。 CD4 T细胞进行了类似的分析,发现在naive T向CD4 Tfh以及CD4 Th1细胞转变的路径后期,来自E组的细胞比NE组更多。
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结合上面两个内容,作者认为CD4 Tfh和CD4 Th1支持了CD8+ Tex的功能
❞
接着探究了一下,是否存在一个signature可用于预测T细胞的克隆扩增。
对DC细胞的分析表明,DC细胞具有免疫响应的特征,可以支持T细胞的功能。
紧接着对巨噬细胞、肿瘤细胞进行分析...
然后是细胞通讯分析...
总结与讨论
课题系统评估了经ICB治疗后,乳腺癌患者的肿瘤内细胞和分子层面的变化;
乳腺癌患者在接受anti-PD1治疗后,是否有一些标志物可以预测T细胞克隆扩增?作者在pre-treatment的免疫微环境中,找到了一些特征。
讲得很棒,我也就听了3遍吧~
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