UK Biobank专题
这个时代的生信,统计遗传,不懂或不会用这个数据库就说不过去了。
看看10年GWAS里是如何定位和评价UK biobank的:
For the near future, the UK Biobank is pushing the barriers further by releasing both genome-wide genotypes and rich phenotypic data on 500,000 people to the international research community.
Nature 4连发 - 这四篇基本把能做的分析都做了
我们应该重点关注的是这个数据挖掘的部分 - health genetics,挖掘得最好的都发在NG上了。
The UK Biobank resource with deep phenotyping and genomic data - 介绍UK biobank数据库的特性
Genome-wide gene-environment analyses of depression and reported lifetime traumatic experiences in UK Biobank - 之前有篇抑郁症depression的NG paper
UKbiobank数据是好,但是基本的分析别人早就做过了,你想再做只能往深处继续挖掘了,否则想发NG是不可能的。
做UKbiobank最大的好处就是考验你的数据挖掘能力,因为一般中小课题组根本拿不到这么大的项目,所以90%搞统计遗传的一辈子都拿不到这样规模的数据,现在UKbiobank免费给你数据,你还不偷着乐啊。
我现在有机会拿到现成的UKbiobank数据,但是能力不足,所以必须先看看别人是怎么做得!
现在最火的当之无愧就是neuron imaging的data
2018 - Association analysis in over 329,000 individuals identifies 116 independent variants influencing neuroticism - 没做什么深入的分析,无非就是找到位点,做了个pathway enrichment而已。
2018 - Genome-wide analyses using UK Biobank data provide insights into the genetic architecture of osteoarthritis
2018 - Genome-wide association meta-analysis of individuals of European ancestry identifies new loci explaining a substantial fraction of hair color variation and heritability
2018 - Signatures of negative selection in the genetic architecture of human complex traits 这才是我期待的最完美的数据挖掘,自成一套的算法,再挖UKBB的数据。
转载于:https://www.cnblogs.com/leezx/p/10805325.html
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