天然产物的活性研究,不少研究人员惯性对天然产物进行细胞增殖抑制试验研究(细胞毒性试验或抗肿瘤活性试验),以期尽快寻找活性突破口,早点发表文章,以免新化合物被抢发!

因此,很多人也不会去研究分子机制,寻找靶点。因为与细胞增殖相关的靶点太多了,增殖异常时,不少生物标志物特异性升高。盲目筛选,耗时耗力,当然主要原因还是经费不足。那是否有其他办法辅助靶点预测呢?

靶点预测

来自中科院合肥物质科学研究院的刘青松研究员等【1】从传统中药石见穿(Salvia chinensis,又名华鼠尾草)分离出20个天然产物,包括6个新的酚酸类衍生物salviachinensines A−F。这六个天然产物均展现出一定的抗增殖活性,其中天然产物salviachinensine A可诱导MOLM-13细胞凋亡及阻滞细胞周期进程。

从石见穿分离出的天然产物

阻滞细胞周期

有些可惜的是,文中并没有深入研究salviachinensine A作用于那个靶点,使其诱导细胞凋亡。为此,小编使用药物靶点预测系统进行预测,试图解开“谜团”:

提交靶点预测任务

系统不需要安装,直接通过浏览器登录即可使用。系统运行速度相当快,提交不到一分钟结果就出来了

靶点预测结果——14-3-3蛋白γ

那14-3-3蛋白为何物呢?14-3-3蛋白广泛存在于多种真核生物中,其作为接头/支架蛋白与其他蛋白质结合,通过多种机制调节它们的生物学功能。现有研究表明14-3-3蛋白参与了信号转导、细胞周期、细胞凋亡、酶活性调节等多种生命活动【2】。

对,细胞周期与细胞凋亡。上述天然产物salviachinensine A不就具有诱导MOLM-13细胞凋亡及阻滞细胞周期进程的生物活性吗?那天然产物salviachinensine A是否是通过抑制14-3-3蛋白,进而诱导细胞凋亡与阻滞细胞周期的呢?也就是说,系统是如何预测到salviachinensine A的靶点是14-3-3蛋白呢?

欲知真相,分子交上——自己上去系统试试不就知道了。。。

相关参考文献:

[1]. Qingsong Liu, et al. J. Nat. Prod. 2018, 81, 2531−2538

[2]. Haian Fu, et al. Exp Cell Res. 2004, 294, 581-591

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