【转】Dicom基础知识

DICOM 文件可以大致分为两部分：
一部分：与图像相关的元信息，包括患者信息，检查信息，序列信息，图像信息等等。
另一部分：图像的像素数据。
在解析DICOM文件中的像素数据的时候，我们先需要读取以下图像相关信息：
以下是某个CT影像中的图像信息示例：

(0028,0002) Samples per Pixel          VR: US Length: 2    Value: 1
(0028,0004) Photometric Interpretation  VR: CS Length: 12    Value: MONOCHROME2
(0028,0010) Rows                      VR: US Length: 2    Value: 512
(0028,0011) Columns                   VR: US Length: 2    Value: 512
(0028,0030) Pixel Spacing             VR: DS Length: 22    Value: 0.48828125\0.48828125
(0028,0100) Bits Allocated             VR: US Length: 2    Value: 16
(0028,0101) Bits Stored                VR: US Length: 2    Value: 12
(0028,0102) High Bit                   VR: US Length: 2    Value: 11
(0028,0103) Pixel Representation       VR: US Length: 2    Value: 0
(0028,1050) Window Center             VR: DS Length: 12    Value: 00100\00100
(0028,1051) Window Width             VR: DS Length: 12    Value: 00500\00500
(0028,1052) Rescale Intercept          VR: DS Length: 6    Value: -1000
(0028,1053) Rescale Slope             VR: DS Length: 2    Value: 1
(0028,2110) Lossy Image Compression    VR: CS Length: 2    Value: 01
(0028,2112) Lossy Image Compression Ratio VR: DS Length: 8    Value: 6.228918

1.(0028,0002) Samples per Pixel
每一个像素的取样数，一般来说，CT，MR，DR等灰度图像都是1，而彩超等彩**图像都是3，分别表示R, G, B三个颜色通道。

2.(0028,0004) Photometric Interpretation
我们经常碰到的Photometric Interpretation有以下几种类型：
Monochrome2  一般的灰度图像都采用这种，Pixel值越大，图像就越白。
Monochrome1 只有部分CR, DR图像使用，Pixel值越大，图像就越黑。
Palette Colour 一般用于彩超图像，每个像素占用8位或者16位，调色板保存在[0028,1201]RedPaletteColorLookupTableData, [0028,1202]GreenPaletteColorLookupTableData, [0028,1203]BluePaletteColorLookupTableData的属性中。
RGB  这是最常用的彩**图像格式。
YBR_FULL  另外一种彩**图像格式，存储格式为Ｙ(Luminance 亮度)， B(Blueness 蓝色)， R（Redness, 红色）
YBR_FULL_422 一般用于JPG有损压缩格式的彩**图像，每两个像素共同使用32位，每一个像素都有自己的Ｙ(Luminance 亮度)，但是共享相同的B(Blueness 蓝色)， R（Redness, 红色）。所以，它的像素值存储方式是：YYBR,YYBT,YYBR
YBR_RCT 用于JPEG 2000无损压缩彩**图*像，Reversible Color Transformation, 可逆色彩变换。
Y = (R+2G+B)/4，  CB = B-G  ， CR = R - G
G = Y - (CR+CB)/4 ,  R = CR + G,  B = CB + G
YBR_ICT 用于JPEG 2000有损压缩彩**图像 Irreversible Color Transformation, 不可逆色彩变换。
Y = + .29900R + .58700G + .11400B
CB = - .16875R - .33126G + .50000B
CR = + .50000R - .41869G - .08131B

3. (0028,0010)Rows
图像的高度

4. (0028,0011)Columns
图像的宽度

5. (0028,0030)Pixel Spacing
图像像素间距，读取Pixel Data的时候不需要，主要用于长度测量。

6. (0028,0100)Bits Allocated
一个像素取样点存储时分配到的位数，一般RGB的图像，每一个颜色通道都使用8位，所以一般取值为8。对于灰度图像，如果是256级灰阶，一般就是8位。如果高于256级灰阶，一般就采用16位。

7. (0028,0101)Bits Stored
一个像素取样点存储时使用到的位数。比方说示例中CT影像，采用的是4K灰阶，像素值取值范围为0~4095，所以使用到的位数为12位。

8. (0028,0102)High Bit
最高位序号，它定义了存储点在分配的内存中的排列方式，它的值是最后一个bit的序号。如果第一个bit放在0位，那么最后一个bit为Bits Stored -1。

9. (0028,0103)Pixel Representation
如果这个值为0，这表明是无符号类型，其VR类型应该为US，Unsigned Short. 如果这个值为1，这表明为有符号类型，其VR类型应该为SS，Signed Short.

10. (0028,1050)Window Center 和 (0028,1051) Window Width
窗宽窗位，不解释

11.  (0028,1052)Rescale Intercept 和 (0028,1053)Rescale Slope
   用于根据像素值计算原始值，比方说，CT可以用于计算HU值。
   比方说：HU = Rescale Slope * X + Rescale Intercept.

12. (0028,2110)Lossy Image Compression
当该值为1时，表明该图像曾经经过有损压缩处理。即使后来解压缩后，再用非压缩格式存储和传输，该值也需要保持为1.

13. (0028,2112)Lossy Image Compression Ratio
有损压缩压缩率。

对于多帧图像，我们还需要读取Number of Frames (0028,0008)来获取帧数，然后，逐帧读取Pixel Data。

对于彩*图像，我们还需要读取Planar configuration (0028,0006)，它定义了各个彩色通道值在Pixel Data中排列的排列方式。
当此值为0的时候，它这样排列的RGBRGBRGBRGBRGB。
当此值为1的时候，它是这样排列的：RRRRR......GGGGG.......BBBBB。对于多帧图像，它是这样排列的：第一帧的RRR..，第一帧的GGG...，第一帧的BBB...,第二帧的RRR..，第二帧的GGG...，第二帧的BBB...

【转】Dicom基础知识相关推荐

【DICOMDIR专题】DICOMDIR基础知识及常见问题汇总
很多网友希望论坛能够出一些更专业.更细分的小专题,DICOMDIR就是目前需求量较大的专题之一.所以,结合网友所需,与几个关心此内容的朋友一起努力,做了一个小专题,希望对你有一些帮助-- DICOMD ...
Dicom 基本知识-开篇
阅读本文大概需要 6 分钟 read-2D Dicom简介 DICOM是Digital Imaging and Communications in Medicine的英文缩写,即医学数字成像和通信标准 ...
新手小白必须了解的数据相关基础知识（一）
不管是做数据标注还是数据清洗.分析等等,大家是不是遇到过如下问题? 提示文件没有软件能打开. 用常用软件打开后乱码. 等等问题,特别是刚接触数据行业的小伙伴,有很多没有计算机背景知识,完全摸不到头脑到 ...
医院考试计算机基础知识,医院信息化计算机基础知识培训.ppt
医院信息化计算机基础知识培训五.医院信息系统常识与维护 1.医院信息系统 2.医学影像信息系统 3.实验室信息管理系统 4.电子病历 5.远程医疗 6.我院信息系统常见问题五.医院信息系统常识与维 ...
嵌入式Linux的OTA更新，基础知识和实现
嵌入式Linux的OTA更新,基础知识和实现 OTA updates for Embedded Linux, Fundamentals and implementation 更新的需要一旦嵌入式Li ...
计算机基础知识第十讲,计算机文化基础（第十讲）学习笔记
计算机文化基础(第十讲)学习笔记采样和量化PictureElement Pixel(像素)(链接: 采样的实质就是要用多少点(这个点我们叫像素)来描述一张图像,比如,一幅420x570的图像,就表示 ...
嵌入式linux编程,嵌入式Linux学习笔记 - 嵌入式Linux基础知识和开发环境的构建_Linux编程_Linux公社-Linux系统门户网站...
注:所有内容基于友善之臂Mini2440开发板一.嵌入式Linux开发环境的构建嵌入式开发一般分为三个步骤: 1.编译bootloader,烧到开发板 2.编译嵌入式Linux内核,烧到开发板 3 ...
《计算机网络应用基础》模拟试卷(六),《计算机与网络应用基础知识1》模拟试卷...
<计算机与网络应用基础知识1>模拟试卷 (4页) 本资源提供全文预览,点击全文预览即可全文预览,如果喜欢文档就下载吧,查找使用更方便哦! 9.9 积分 <计算机与网络应用基础知识1& ...
python向量计算库教程_NumPy库入门教程：基础知识总结
原标题:NumPy库入门教程:基础知识总结视学算法 | 作者知乎专栏 | 来源 numpy可以说是 Python运用于人工智能和科学计算的一个重要基础,近段时间恰好学习了numpy,pandas, ...

【转】Dicom基础知识

【转】Dicom基础知识相关推荐

最新文章

热门文章