蛋白质组学是我国目前生命科学研究最热的领域之一,蛋白质组学的研究对提高我国生物医学原始创新能力、重大疾病防诊治能力和国民健康水平以及新药研发能力、生物医药产业的发展具有重大的战略意义。今天小析姐就和大家一起聊一聊蛋白质组学的三大支撑技术。

现在开始正题,什么是蛋白质组学,Proteomics includes not only the identification and quantification of proteins, but also the determination of their localization, modifications, interactions, activities, and, ultimately, their function。

我们主要讲的就是identification and quantification of proteins,这就引出了两类文章,第一种是尽可能多的鉴定细胞或组织中一切蛋白质,这一部分跟分析化学有关就不多讲,第二种是差异蛋白质组学,通过寻找各种因素引起的蛋白质表达差异,以解释细胞生理和病理机制。

从医学角度来看,蛋白质组学整个实验流程简单易懂。第一步,不同组织或细胞样品间的蛋白质的分离,第二步蛋白质鉴定、定量,找出有显著表达差异的蛋白。第三步,在此基础上选定蛋白进行验证,最后生信分析(如下图)。

其中分离有两套不同的流程,第一个是top-down(直接分离蛋白质),主要技术是二维电泳(不推荐,很麻烦)。第二个是buttom-up(分离蛋白质酶解后得到的多肽),主要技术是LC。

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