MS

电荷密度在

Origin

中作图方法

很早就想把这个给大家分享,因为看到一些虫子还在为此发愁。我也用过

matlab

,但结果不甚理想,所以就想如何在

origin

中快速实现。

1

Total density map

现在

MS

save

为文件,当然你需要将你的隐藏文件和扩展名都能显示,在结果文件夹中找到

*.chrgm(

好像是

).charg_frm

文件

origin

中导入这个文件

,

得到

4

列数据

,

分别为

a, b, c,

charge.

一般的排序是先将

a=1,

对应的

b,c

不同

,

然后才是

a=2

,

以此类推

.

如果你想做

(100)

,

b, c, charge

列分别设为

x, y, z

轴,那么就只选中

a=1

对应的所有的

b, c, charge

数据,然后直接可以做出

(100)

面得电荷密度等

高线图,通过调节,可以得到很好的图片。

(????怎么插图片啊???)

如果想得到(

010

)面的,将原来的数据的

b

列推至首列,然后选中首列,右键单击选择

sort worksheet

,这样就会对

b

列的数据按从小到大的顺序排列,

而与之对应的

a

c

charge

随之改变。

按同样的方法可得到(

010

)面得电荷密度。

2

、差分电荷密度

MS

中只能给出显示,存为文件后却无法打开。昨天在一个会上问

M

C

Payne

这个问题,他解释说不是他的错,是公司的问题。

(具一个牛人说,可用命

令行运行后,可得到数据文件。还没试)

。如果就现在的差分密度图片如何在

Origin

中做出来呢?

你需要做的也很简单。

MS

的差分密度图片显示后,

隐藏其它

(包括原子)

存为

.bmp

文件。

然后在

origin

中新建一个空

matrix

表格。

File

import

中选择

image

,按照默认方式导入刚才的

.bmp

文件。然后选择你需要的区域,点击右键形成新的

Matrix

表(其实现实的还是图片)

再到

view

中的

view

mode

选择数据,你会得到一个很奇怪的

matrix

表,别管他,直接对这个

matrix

contour

图,你会得到差分密度图了,要想获得

好的效果,需要很仔细地调节。具体办法,实在太难写出来,等以后再说吧。

本想贴几张我的结果,但不知如何贴。请斑竹给我指示!

!好,知道了。

上面一张是根据下面

MS

给出的差分密度

map

Origin

做出来的。由于为了满足附件的大小限制,对

origin

的输出做了压缩和色度限制,这只是今天初

略做的,没有做详细的调节。

其实关键在于,国外期刊一般倾向你提交

.eps

格式的图片文件,如果你将

.bmp

通过画图来转为

.jpg

,然后再用

jpeg2ps

程序转为

.eps

,效果实在不敢恭

维。

所以利用

origin

直接输出

.eps

格式的图片,效果很好,而且不失真,属于矢量图。

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