Haploview做单倍型分析
自个数据用Haploview做单倍型分析
直接CTRL+H就行了.无基因型的以(0 0)表示,注意,两数字中间有一个空格. (4.2以上的版本可以识别ATCG滴,不需要分成2列吗)
完成,你不光会得到图,还会得到其它信息. 你也可以根据一些设置调整图的算法或色彩. 以下是一些步骤图片: 第一步示意图 (不要表头的) |
第二步示意图 (4.2版本滴就不需要转换了)
第三步示意图 (只有2列,这个SNP的locus可以用相对距离,也可以用绝对距离)
第四步示意图
第五步示意图
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