R语言绘制生存曲线估计|生存分析|如何R作生存曲线图
根据生存曲线的估计,可以推断出相比组之间存活时间的差异,因此生存曲线非常有用,几乎可以在每个生存分析中看到。我们围绕生存分析技术进行一些咨询,帮助客户解决独特的业务问题。
例
我们可以创建简单的生存曲线估计。让我们来看看患有卵巢癌(卵巢浆液性囊腺癌)和患有乳腺癌(乳腺浸润癌)的患者之间存活时间的差异 。
视频:R语言生存分析原理与晚期肺癌患者分析案例
R语言生存分析Survival analysis原理与晚期肺癌患者分析案例
fit <- survfit(Surv(times, patient.vital_status) ~ admin.disease_code,data = BRCAOV.survInfo)
这个简单的图表以优雅的方式呈现了生存概率的估计值,该估计值取决于根据癌症类型分组的癌症诊断天数和信息风险集表,其中显示了在特定时间段内观察的患者数量。生存分析是一个特定的数据分析领域,因为事件数据的审查时间,因此风险集大小是视觉推理的必要条件。
ggplot(fit, # 生存数据对象.data = BRCAOV.survInfo, # 生存数据. risk.table = TRUE, # 风险表.pval = TRUE, # Logrank检验p-valueconf.int = TRUE, # 生存曲线置信区间.xlim = c(0,2000), #生存预测.break.time.by = 500, ggtheme = theme_minimal(), risk.table.y.text.col = T, risk.table.y.text = FALSE
)
每个参数都在相应的注释中描述,但我想强调xlim
控制X轴限制但不影响生存曲线的参数,这些参数考虑了所有可能的时间。
比较
基础包
看起来很漂亮.....
R语言绘制生存曲线估计|生存分析|如何R作生存曲线图相关推荐
- r语言绘制精美pcoa图_「R」数据可视化5:PCA和PCoA图
其实不论是PCoA还是PCA图均是用散点图来展示结果PCoA和PCA的结果,PCoA和PCA准确来讲是数据降维分析方法. 什么是PCA和PCoA 主成分分析(Principal components ...
- R语言绘制生存曲线图
R语言绘制生存曲线图 KMunicate是支持按照Morris等人的KMunicate研究推荐的方式生成Kaplan-Meier图. 1958年,Edward L. Kaplan 和Paul Meie ...
- 如何使用R语言绘制生存曲线图
在预后研究中,生存曲线是常见的图片之一,目的是描述各组中患者的生存情况.好的生存曲线图不仅可以令读者.编辑和审稿专家眼前一亮,也能为论文增色不少. 接下来跟大家分享如何用R语言绘制生存曲线图. 第一步 ...
- 【R语言文本挖掘】:情感分析与词云图绘制
[R语言文本挖掘]:情感分析与词云图绘制
- 基于R语言的Copula变量相关性分析及应用
在工程.水文和金融等各学科的研究中,总是会遇到很多变量,研究这些相互纠缠的变量间的相关关系是各学科的研究的重点.虽然皮尔逊相关.秩相关等相关系数提供了变量间相关关系的粗略结果,但这些系数都存在着无法克 ...
- R语言绘制复杂抽样设计logistic回归限制立方样条图(RCS)
最近很多人问怎么使用R语言绘制NHANES数据复杂抽样设计限制立方样条图(RCS),NHANES数据属于复杂抽样调查,涉及到抽样权重.不能按既往的RCS绘制方法来绘制. 今天来演示一下,我手头上并没有 ...
- R语言绘制带聚类树的堆叠柱形图
R语言绘制带聚类树的堆叠柱形图 聚类树与柱形图结合,即可反映样本或分组间的相似性,又能展示样本内的元素组成信息. 例如下图是一个在扩增子测序微生物群落分析中常见的统计图类型,在测序公司给的报告中通常都 ...
- r语言绘制精美pcoa图_R语言绘制交互式热图
热图 通过热图可以简单地聚合大量数据,并使用一种渐进的色带来优雅地表现,最终效果一般优于离散点的直接显示,可以很直观地展现空间数据的疏密程度或频率高低.但也由于很直观,热图在数据表现的准确性并不能保证 ...
- 单因素方差分析_基于R语言开展方差分析(一)——单因素方差分析
基本原理 方差分析(Analysis of variance, ANOVA)是用于两个或两个以上样本均数比较的方法,还可以分析两个或多个研究因素的交互交互作用以及回归方程的线性假设检验等.其基本思想是 ...
- 数据可视化——R语言绘制散点相关图并自动添加相关系数和拟合方程
数据可视化--R语言绘制散点相关图并自动添加相关系数和拟合方程 加载所需的包并设置主题样式 示例数据 基本的散点相关图 添加相关系数和显著性水平(P值) 存在多个组别的散点相关图 自动添加回归曲线的拟 ...
最新文章
- 什么是第三方物流管理?如何套用模板进行绘制
- 在Winform中播放视频等【DotNet,C#】
- 查看Linux进程CPU过高具体的线程堆栈(不中断程序)
- CSDN之人人code,整数取反
- mysql 数据库查看锁表_【数据库】MySQL查看是否锁表
- MATLAB实现控制鼠标移动和点击
- Centos下docker相关文件迁移发生的问题记录
- 金融知识图谱的现状与展望
- 硅谷天才CEO被罢免10天后绝地反击,重夺控制权
- 文王八卦圖와 易經組織
- 本地开发微信网页时如何调试微信sdk
- 学习 C++,关键是要理解概念,而不应过于深究语言的技术细节
- TGRS2020/云检测:Deep Matting for Cloud Detection in Remote Sensing Images深度抠图在遥感图像云检测中的应用
- 20145212罗天晨 逆向及Bof基础实践
- 色彩和色调(色相,明度,冷暖,纯度)
- 罂粟花乄傷:最开心生活细节
- 香港金融中心谁与争锋
- jQuery 插件开发——Menu(导航菜单)
- 19.1 NESMA 唯一和非唯一搜索条件的组合 案例研究
- 内行看门道:看似“佛系”的《QQ炫舞手游》,背后的音频技术一点都不简单...
热门文章
- 互联网平台如何快速搭建内容安全审核系统?
- 多多情报通:拼多多什么软件可以看到大数据?拼多多大数据分析软件有哪些?
- 用计算机找终身伴侣,五个经典问题决定你是否找到终身伴侣
- Flutter加载大图内存问题处理
- Adobe illustrator安装
- 让my97 datepicker兼容ie9、ie10、ie11
- (淘宝无限适配)移动手机端rem布局详解(转载非原创)
- 数学方法002 | 利用恒等式证明不等式
- We're on the cusp of deep learning for the masses. You can thank Google later
- 一文看懂互联网支付系统架构