根据生存曲线的估计,可以推断出相比组之间存活时间的差异,因此生存曲线非常有用,几乎可以在每个生存分析中看到。我们围绕生存分析技术进行一些咨询,帮助客户解决独特的业务问题。

我们可以创建简单的生存曲线估计。让我们来看看患有卵巢癌(卵巢浆液性囊腺癌)和患有乳腺癌(乳腺浸润癌)的患者之间存活时间的差异 。

  视频:R语言生存分析原理与晚期肺癌患者分析案例

R语言生存分析Survival analysis原理与晚期肺癌患者分析案例


fit <- survfit(Surv(times, patient.vital_status) ~ admin.disease_code,data = BRCAOV.survInfo)

这个简单的图表以优雅的方式呈现了生存概率的估计值,该估计值取决于根据癌症类型分组的癌症诊断天数和信息风险集表,其中显示了在特定时间段内观察的患者数量。生存分析是一个特定的数据分析领域,因为事件数据的审查时间,因此风险集大小是视觉推理的必要条件。


ggplot(fit,                     # 生存数据对象.data = BRCAOV.survInfo,  # 生存数据. risk.table = TRUE,       # 风险表.pval = TRUE,             #    Logrank检验p-valueconf.int = TRUE,         # 生存曲线置信区间.xlim = c(0,2000),         #生存预测.break.time.by = 500,      ggtheme = theme_minimal(),  risk.table.y.text.col = T,  risk.table.y.text = FALSE
)

每个参数都在相应的注释中描述,但我想强调xlim控制X轴限制但不影响生存曲线的参数,这些参数考虑了所有可能的时间。

比较

基础包

看起来很漂亮.....


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