大家好,我是小马老师。
对于一些金属体系的变形模拟,在lammps运算完成后,通常需要将轨迹文件导入到ovito进行分析。
ovito分析晶体变形的方法有很多,比如DXA、CNA等。
在一些论文中,会使用下图的方法分析晶内变形情况:

下面介绍一下这种图像的绘制方法。
(1)ovito打开轨迹文件
以Ni的拉伸模拟结果为例,拉伸轨迹文件导入到ovito中如下图所示:

(2)调用位错分析DXA
“Add modification”-“Dislocation analysis”

调用DXA后,主界面会以不同的颜色显示不同的相,并标出位错线位置。
下面通过删除部分相观察晶内变形情况,如删除FCC相。
(3)添加公式选择
“Add modification”-“Expression selection”

在下面的公式输入框中输入:
(StructureType ==1 || StructureType ==0) && (Position.X <= 105 && Position.X >= 0)
StructureType对应不同的相,例如1为绿色fcc相,0为白色other。
Position.X设置为只选择x坐标位于[0,105]之间的原子,这个根据个人需要设置,可用也可以不用。
(4)删除选定原子
“Add modification”-“Delete selected”
删除选定原子,为显示方便,可关闭“Simulation cell"、“Defect mesh”。
如果显示不清晰,可添加阴影渲染"Ambient occlusion"

这个案例给大家提供一种后处理思路,至于需要删除哪些原子以及保留哪部分数据,要根据模型具体情况具体分析,模型不同或者分析侧重点不同,处理方法可能会不同。
如果在使用lammps过程中遇到什么问题,可到公众号或者QQ群留言。
公众号案例代码以及学习交流,请加QQ群:754749935

扫描关注微信公众号:lammps加油站。

lammps教程:Ovito查看晶体内部变形方法相关推荐

  1. lammps教程:CNA晶体结构分析命令

    大家好,我是小马老师. 本文介绍lammps计算CNA的方法. CNA(公共邻居分析)可用来分析原子周围局部晶体结构,如FCC.BCC.HCP以及晶体缺陷. 在ovito后处理软件中有CNA的计算,但 ...

  2. lammps教程:lj/cut力场使用方法

    lammps模拟设置中,力场的设置非常重要,力场设置合理才能准确的描述原子之间的受力. 如果两种原子之间没有键连接,可以使用pair_style命令设置这两种原子的力场. pair_style能够设置 ...

  3. lammps教程:OPLS势函数参数设置方法

    大家好,我是小马老师. 本文介绍OPLS势函数的设置方法. lammps力场大体分为两种情况: 一种类似于eam这种势,参数是写到eam力场文件中的,在使用的时候需要下载力场文件,在设置时不需设置力场 ...

  4. lammps教程:cvff势函数参数设置方法

    大家好,我是小马老师. 本文介绍lammps模拟中cvff势设置方法. cvff势由pair.bond.angle.dihedral.improper等势组成,在ms中直接设置cvff势即可,但是在l ...

  5. 查看win8序列号的方法图文教程【系统天地】

    最近有朋友问小编win8序列号查看方法是什么,对于这个问题,很多朋友都知道如何查看,但是还有很多新手朋友不懂得如何查看win8序列号,其实只有正版的win8系统才有序列号,那么我们应该如何查询到自己的 ...

  6. ios修改apn的插件_苹果iPhone查看和编辑APN方法教程

    iPhone怎么查看和编辑APN?很多小伙伴们都还不知道,下面小编为大家整理了苹果iPhone查看和编辑APN方法教程,一起来看看吧. iPhone怎么查看和编辑APN 如果您输入了错误的 APN 设 ...

  7. lammps教程:Cu孪晶建模方法

    上一次文章介绍了Atomsk软件建立孪晶的方法,有朋友咨询使用lammps自带命令建立孪晶的方法. 本文以Cu为例介绍lammps孪晶建模方法. 使用lammps建模,首先要确定xyz坐标轴对应的晶向 ...

  8. lammps教程:径向分布函数g(r)的计算与输出方法

    大家好,我是小马老师. 本文介绍如何使用lammps计算径向分布函数g®. 径向分布函数(Radial distribution function)是指给定某个粒子的坐标,其他粒子在空间的分布几率. ...

  9. lammps教程:实例讲解npt、nvt系综的选择

    对于lammps新手来说,系综的选择令人困惑,到底是应该用nvt系综还是npt系综? 我在初学lammps时就被这个问题困扰了很久.如果去问别人,可能会告诉你一个答案:根据模拟需要确定. 其实和没说一 ...

  10. lammps和atomsk中常用的建模方法

    文章目录 1.Atomsk生成刃型位错 2.Atomsk生成任意角度晶界 3.Atomsk生成孪晶 4.Atomsk生成非晶 5.合金多晶结构建模 6.Atomsk建立管道类模型 7.Atomsk建立 ...

最新文章

  1. Python OOP知识积累
  2. 题目1483:求最大最小数
  3. Selenium2Lib库之输入常用关键字实战
  4. 【数据结构与算法】之深入解析“最长有效括号”的求解思路与算法示例
  5. 【STM32】系统配置控制器相关函数和类型
  6. 【Linux】一步一步学Linux——crontab命令(132)
  7. 每次请求刷新token的时间
  8. github 创始人_GitHub联合创始人Scott Chacon的视频采访,探讨代码之外的未来
  9. SQL Server JSON:性能手册
  10. heX:用HTML5和Node.JS开发桌面应用
  11. 华为机试HJ38:求小球落地5次后所经历的路程和第5次反弹的高度
  12. windows环境下oracle安装教程
  13. ArcGIS教程 - 2 ArcGIS基础知识
  14. DS18B20温度传感器-51单片机控制程序
  15. Windows系统口令扫描之——使用NTScan扫描Windows口令
  16. 三、python数据序列1-列表
  17. 零基础如何学习SEO网站优化
  18. 桌面窗口管理器dwm.exe内存过高,intel核显内存泄漏问题(附核显升级链接)
  19. Java基础概念——变量联系-计算公交车的人数
  20. mysql中高阶玩法系列(九)

热门文章

  1. C primer plus 第六版pdf下载
  2. oppok3如何刷机_OPPO K3刷机教程?
  3. 四叶草引导linux教程,百科全书之黑苹果四叶草引导配置 boot讲解
  4. Unity获得汉字拼音或首字母
  5. 宝塔面板 python管理器2.0安装Mrdoc
  6. java车牌号识别EasyPR_EasyPR-Java
  7. 线性代数、微积分学习与回顾
  8. 缠中说缠,最好用的缠论画笔和中枢的指标公式 通达信用
  9. SSR (misa + primer3 ) 设计SSR引物
  10. 使用Scikit Learn的分类器探索Iris数据集