Ensemble查看基因的外显子信息,并根据染色体位点判断是第几号外显子

最近遇到一个困扰,就是在分析一些数据的时候,可以分析出它的染色体起始位置和终止位置,但是并不能知道该位点具体位于几号外显子上,整理了下查找步骤。

1)打开ensemble官网

https://useast.ensembl.org/index.html

选择物种,点击进入页面

2)选择对应的ensemble版本的注释文件,我的分析用的是GRCm38版本的信息,所以我选择了GRCm38的

根据图片步骤进行查询

3)搜索结果,点击进入

4)展示隐藏起来的转录本表格信息

5)根据转录本id,点击进入,点击exon信息,即可展示所有的exon信息

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