此前小编已经为大家整理过 

空转工具盘点 | 空间转录组细胞类型聚类方法综合比较相关推荐

  1. 热点综述 | 单细胞+空间转录组的整合分析方法总结

    目前scRNA-seq将每个转录物与单个细胞相关联,但关于这些转录物在组织中的位置信息丢失了:相反的,空间转录组学技术知道转录物的位置,却不知道是哪个细胞产生了转录物.因此,scRNA-seq与空间转 ...

  2. Nat. Mach. Intell. | 基于神经网络的迁移学习用于单细胞RNA-seq分析中的聚类和细胞类型分类...

    今天给大家介绍由美国宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院生物统计学,流行病学和信息学系Jian Hu等人在<Nature Machine Intelligence>上发表了一篇名为"It ...

  3. 单细胞及空间转录组高分文章解析!ceRNA学习!

    培训背景 单细胞测序是从单个细胞水平对基因组和转录组进行研究.2015年以来,10X Genomics.Drop-seq.Micro-well.Split-seq等技术的出现,彻底降低了单细胞测序的成 ...

  4. 空间转录组分析流程(使用Seurat对空间数据集进行分析)

    空间转录组分析流程(使用Seurat对空间数据集进行分析) 因为每次打开这个网页都非常慢,所以我讲这个网页进行一个翻译,方便学习. 使用Seurat对空间数据集进行分析,可视化和集成 1.介绍 本教程 ...

  5. scBERT:用于scRNA-seq细胞类型注释的大规模预训练语言模型

    目录 背景与动机 结果 scBERT gene embedding expression embedding 结果表现 背景与动机 单细胞RNA测序(scRNA-seq)已广泛用于在单细胞水平表征复杂 ...

  6. ClusterMap:用于空间基因表达的多尺度聚类分析 | 空间转录组分析工具推荐

    在空间背景下量化RNA是了解复杂组织中基因表达和调控的关键.原位转录组方法可以在完整的组织中产生空间分辨率的RNA图谱.然而,目前还缺乏一个统一的计算工具来综合分析原位转录组数据.2021年10月,N ...

  7. Celaref | 单细胞测序细胞类型注释工具

    我导再也不用担心我不认识marker啦 我们在进行单细胞测序的时候,通常情况下是通过高变genes来辨别细胞类型(于是一大堆不认识的),除了免疫细胞可能容易分析出来,其他的细胞我是两眼一抹黑.虽然具有 ...

  8. SCS【6】单细胞转录组之细胞类型自动注释 (SingleR)

    点击关注,桓峰基因 桓峰基因公众号推出单细胞系列教程,有需要生信分析的老师可以联系我们!首选看下转录分析教程整理如下: Topic 6. 克隆进化之 Canopy Topic 7. 克隆进化之 Car ...

  9. NC:利用SpaceFlow分析组织中细胞的时空模式 | 空转工具推荐

    分析空间转录组数据集的一个主要挑战是同时合并细胞转录组相似性及其空间位置.近日<Nature Communications>发表了一个灵活的深度学习框架:SpaceFlow,在分析空间转录 ...

最新文章

  1. 第五课.可变图结构下的归纳式学习图注意力
  2. SparkStreaming读取Kakfa数据时发生OffsetOutOfRangeException异常
  3. 在python程序中的进程操作
  4. autocad完全应用指南_建筑绘图慢?580页的AUTOCAD完全自学必备指南,高效绘图不求人...
  5. 使用Spring跟踪异常–第2部分–委托模式
  6. LYNC文件传输功能开关
  7. as_hash ruby_Ruby中带有示例的Hash.each_pair方法
  8. Windows下安装python2和python3双版本
  9. FID使用(Frechet Inception Distance score)
  10. Python3 使用requests请求,解码时出错:'utf8' codec can't decode byte 0x8b in position 1: invalid start byte...
  11. 打工的人面对老板是没有溢价权的
  12. shell脚本中判断大于、小于、等于、不等于的符号
  13. 自动血压呼吸检测仪技术方案
  14. 论文(0):下载ieee期刊会议杂志论文模板流程--以IEEE RA-L为例
  15. SketchUp 8 Pro 安装插件 没有安装扩展程序按钮 rbz插件安装
  16. 计算机英语二国家线,历年考研英语国家线一览表
  17. 为什么说Redis单线程效率高
  18. 图像处理系列——图像融合之加权平均(WA)
  19. 5款知名bug管理工具
  20. 电脑蓝屏黑屏无法开机.BIOS更新.进不去系统只能重装?驱动人生解决方案

热门文章

  1. 马斯克和扎克伯格线上约架,地点“票价”都已定;超10万个ChatGPT账号泄露;苹果推出Vision Pro开发工具|极客头条
  2. 使用python 520表白吧(转)
  3. python 数据分组后看每组多少个_【Python】分组统计GroupBy技术详解
  4. mac访问ftp服务器不显示,Mac连不上ftp怎么办
  5. http://www.xueh188.top/index.php/archives/3/
  6. css3 小图标提示特效
  7. turn.js 翻书效果
  8. 使用Syncthing同步数据
  9. 公众号商城报错修复 未授权使用地图 API错误
  10. 用python爬取快手评论(烂活新整)