PETSc: Cygwin环境下安装实践
Cygwin环境下安装实践
方便学习使用PETSc，在Cygwin环境下进行安装实践。
用py进行配置，config/examples下面有多种环境下的py脚本可参考修改
| 环境 | 说明 | 备忘 |
|---|---|---|
| py配置脚本 | arch-ci-mswin-gnu.py | 进行适当修改 |
| gcc | 11.3.0 | |
| openmpi | 保证用mpicc/mpicxx/mpif90编译连接MPI程序成功 | |
| zlib-devel,libhwloc-devel,libevent-devel | openmpi的依赖库 | openmpi需要依赖库(mpicc -showme)，保证已经安装，安装openmpi并不能保证这些依赖已经安装(坑) |
| cygchek -c | 能列出cygwin所有安装包 |
arch-ci-mswin-gnu.py内容
#!/usr/bin/env python3configure_options = [# Autodetect cygwin blas/lapack, OpenMPI'--with-debugging=0','--with-make-np=4','--with-cc=/usr/bin/mpicc','--with-cxx=/usr/bin/mpicxx','--with-fc=/usr/bin/mpif90','--COPTFLAGS=-O3 -march=native','--CXXOPTFLAGS=-O3 -march=native','--FOPTFLAGS=-O3 -march=native','FFLAGS=-fno-backtrace -ffree-line-length-0','--download-metis',#'--download-mumps=$HOME/github.dir/petsc/MUMPS_5.5.0.tar.gz','--download-parmetis',#'--download-scalapack','--download-fblaslapack','--with-cxx-dialect=C++14','--with-shared-libraries=0',]if __name__ == '__main__':import sys,ossys.path.insert(0,os.path.abspath('config'))import configureconfigure.petsc_configure(configure_options)碰到的坑备忘
- openmpi安装后，有几个依赖包要独立安装好，保证mpicc/mpicxx/mpif90能编译连接成功
- 碰到问题仔细阅读PETSc的配置日志configure.log
- PETSc自动下载第三方包时候，会失败，可以手动将包下载后，指定具体位置（碰到MUMPS包下载失败情况)
- Cygwin没有openblas-devel包，PETSc找不到blas头文件，使用了PETSc自动下载的fblaslapack第三方包
- mumps包需要scalapack, scalapack编译有问题，可剔除mumps
- 编译静态库,动态库可能有问题(–with-shared-libraries=0）
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