放射组学常用到的一些工具(软件)
这几天看到一篇文章是关于“Computational resources for radiomics”,对里面涉及的工具(软件)做了一下总结,感兴趣的可以找一下原paper(下载链接:http://tcr.amegroups.com/article/download/8409/pdf)看看。
Treatment planning systems/查看工具(勾画ROI):
3DSlicer(www.slicer.org)
MIM(www.mimsoftware.com)
itk-SNAP(www.itksnap.org)
DefiniensLung Tumor Analysis (LuTA) tool (www.definiens.com)
Velocity ROI delineation tool (www.velocitymedical.com)
Image feature extraction/特征提取工具:
TexRAD(www. texrad.com)
MaZda(http://eletel.eu/mazda)
Chang-Gung Image Texture Analysis (CGITA) (http://code.google.com/p/cgita)
IBEX (Stand-aloneIBEX: http://bit.ly/IBEX_MDAnderson;
Source-code version: http://bit.ly/IBEXSrc_MDAnderson)Computational environment for radiotherapy research (CERR) (www.cerr.info)
ITK,itk.org
Modeling/statistical analysis/分析特征的工具:
R (www.r-project.org/).
SPSS(www.ibm.com/software/analytics/spss).
Stata(www.stata.com).
MedCalc(www.medcalc.org).
Bioconductor(www.bioconductor.org).
Weka(www.cs.waikato.ac.nz/ml/weka/).
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