MedMNIST:上海交大发布医学影像领域的MNIST(附下载)
今天上海交大的研究学者发文 MedMNIST Classification Decathlon: A Lightweight AutoML Benchmark for Medical Image Analysis ,公布了其收集整理的10个医学领域的图像数据集MedMNIST,旨在促进AutoML(自动机器学习)在医学领域的技术研究。
作者信息:
这10个数据集示例:
该数据集特点:
利于研究教学:数据来自具有知识共享(CC)许可的多个开放式医学图像数据集,易于用于教育目的。
标准化:将数据预处理为相同格式,无需用户了解任何背景知识
多样性:涵盖了各种数据规模(从100到100,000)和任务(二分类/多类分类,有序回归和多标签学习)。
轻量级:28×28的图像大小适合快速原型设计和试验多模态机器学习和AutoML算法。
该数据集相关统计:
可见覆盖了常见的医学影像数据源:病理图片、胸部X光、皮肤镜、超声、眼底摄影、OCT、CT等。
另外,作者提供了代码,在此10个数据集上进行了人工设计网络和常见AutoML工具设计的模型的评测,结果如下:
可见:
Google AutoML Vision 在大多数情况下都表现不错,但相比手工设计的 ResNet-18/50也有逊色的时候;
auto-sklearn 的表现一直很稳定的差 /sad;
AutoKeras 在数据量较大的数据集上表现很好,在数据量小时往往不佳。
总之,以上AutoML工具在MedMNIST面前没有完美胜出者,这也说明MedMNIST对于研究者来说是个好数据集。
最后附上项目主页:
https://medmnist.github.io/
论文地址:
https://arxiv.org/abs/2010.14925
Demo代码地址:
https://github.com/MedMNIST/MedMNIST
下载:
原数据地址国内无法下载,不过不用担心,在“我爱计算机视觉”公众号后台回复“MedMNIST”,即可收到论文、代码、数据打包下载链接。
END
备注:医学影像
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