如何使用peakview软件查看AB SCIEX 质谱下机数据
一、软件安装
1、解压软件安装包,打开Launch程序(以管理员模式安装,安装前请退出杀毒软件)
2、打开安装程序,找到InstallAnalyst TF 1.6 Software,单击打开进行安装
3 、按默认安装程序完成软件安装,安装完成后桌面出现 Analyst TF 1.6 Software 快捷方式
4、接下来,重新打开步骤1中的 Launch 安装程序,点击 Install Companion Software →PeakView 1.2
5 、同样按照默认程序, 点击下一步完成安装,软件安装完成后打开 Analyst TF 1.6 ,可以找到安装好的 PeakView 软件, 双击打开
或者找到桌面快捷方式直接打开(下图)
6、打开后,界面如下:
7、单击 Help→Utilities →XIC Manager Installer.msi,双击 XIC Manager Installer.msi,按默 认进行安装,安装完成后重启软件, 发现菜单栏中已经出现 XIC Manager 选项,说明软件安 装完成。
小结:软件没有时间使用限制,需要安装包的可以关注一下公众号并私信一下小编获取,谢谢。软件仅限于科研查看原始数据使用。
二、软件使用
1、导出TIC总离子流图
1.1(File-open wiff Sample-打开数据路径-选择要打开的原始数据-OK)
1.2(Show-Total Ion Chromatogram(TIC))
1.3(选择MS1-OK)
1.4 放大目标图片
1.5打印成PDF(File-Print-Print Pane)
2、根据特定质荷比导出EIC图
2.1打开原始数据(方法同1.1)
2.2.(Show-Extract Ion Using Dialog(XIC))
2.3(选择MS1-OK)基于1级进行抽提
2.4 在Center中输入质荷比,在Width中输入绝对质量误差0.05(Da),有名字的可在Compound中输入名字或者ID号代替。点击OK.
如果是我司做的质谱检测,质荷比可以直接从质谱鉴定EXCEL表中选择输入,Precursor m/z为目标离子质荷比、RT (min)为该离子出峰的保留时间。
也可以通过分子式计算,理论质荷比,进行抽提。peak view也提供理论质荷比。方法如下:
A:Show-Mass Calculators
B:Isotopic Distribution-输入目标分子式-输入电荷,小分子一般为1或者-1,再选择加合离子H-点Calculate,得到理论质荷比。
2.4 得到EIC谱图,可打印成PDF(File-Print-Print Pane)
3、查看目标峰二级谱图
3.1打开原始数据(方法同1.1)
3.2提取目标一级EIC图,以确定保留时间(方法参考2、根据特定质荷比导出EIC图)
3.3根据目标峰的保留时间,点击IDA模式质谱图(含2级谱图),点显示谱图信息
3.4选择1级、2级谱图分开显示模式,如下图
3.5通过键盘中“←”“→”左右箭头键盘,找到目标离子,二级谱图。
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