项目场景：

RNA-seq对比对后bam文件绘制insert图片

问题描述：

执行picard命令时发生报错：
JAVA报错代码：

    at java.lang.ClassLoader.defineClass1(Native Method)at java.lang.ClassLoader.defineClass(ClassLoader.java:800)at java.security.SecureClassLoader.defineClass(SecureClassLoader.java:142)at java.net.URLClassLoader.defineClass(URLClassLoader.java:449)at java.net.URLClassLoader.access$100(URLClassLoader.java:71)at java.net.URLClassLoader$1.run(URLClassLoader.java:361)at java.net.URLClassLoader$1.run(URLClassLoader.java:355)at java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method)at java.net.URLClassLoader.findClass(URLClassLoader.java:354)at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:425)at sun.misc.Launcher$AppClassLoader.loadClass(Launcher.java:308)at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:358)at sun.launcher.LauncherHelper.checkAndLoadMain(LauncherHelper.java:482)

原因分析：

JAVA版本错误
其他软件的安装导致JAVA版本更换，造成环境污染

$ java -version
openjdk version "1.7.0_91"
OpenJDK Runtime Environment (Zulu 7.12.0.3-linux64) (build 1.7.0_91-b15)
OpenJDK 64-Bit Server VM (Zulu 7.12.0.3-linux64) (build 24.91-b15, mixed mode)

当前picard需要java 8.0及以上版本才能运行。

解决方案：

更新openjdk到兼容版本

conda install openjdk==9.0.7

安装完成后检查picard能否正常运行

picard

显示正常，问题解决。

2021.11.23【bug笔记】丨picard运行报错：Exception in thread “main“ java.lang.UnsupportedClassVersionError相关推荐

IDEA运行redis多线程访问报错Exception in thread “main“ java.lang.NoClassDefFoundError: org/slf4j/LoggerFactory
错误样式: 解决方案: 下载两个JAR包即可,同样的代码我在MyEclipse中运行就不报错,可能是IDEA缺少这两个JAR包吧,而ME本身自带了托管下载地址:Central Repository: ...
【亲测有效】如何解决Hadoop运行jar包报错Exception in thread “main“ java.lang.ClassNotFoundException: /input
报错解释字面意思就是我要运行这个jar但是Java无法找到主类试错过程你可能会在这里添加主类,但是还是不行.你可能没辙了. 解决办法 <build><finalName> ...
【错误记录】Groovy 运行报错 ( Exception in thread “main“ groovy.lang.MissingMethodException: No signature of )
一.报错信息在使用 Groovy 闭包时 , 会报如下错误 : Exception in thread "main" groovy.lang.MissingMethodExcep ...
关于jar包运行报错：Exception in thread “main“ java.lang.UnsupportedClassVersionError的解决办法
打包jar包后 ,在jar路径下cmd使用命令 java -jar jar包名字报错: Exception in thread "main" java.lang.Unsuppo ...
运行jar文件出现了Exception in thread “main java.lang.UnsupportedClassVersionError
过程:自己编写了一个从数据库中导出大表到excel的小程序,在windows上运行时报错啦. 错误如下: 经过分析发现: Eclipse中的JDK是10的,如下: windows运行jar文件环境的j ...
运行错误：Exception in thread “main“ java.lang.NoClassDefFoundError: org/apache/commons/logging/LogFactor
这是我们在做OSS文件上传时容易发生的错误,提示说没有日志相关的类,是因为没有导入相关的jar包,所以我们只需要导入一个commons-logging就好了 <!-- https://mvnre ...
运行java项目时Exception in thread “main“ java.lang.UnsupportedClassVersionError解决办法
java -jar test.jar 执行jar时遇到的问题如下: Error: A JNI error has occurred, please check your installation an ...
Linux运行Java出现“Exception in thread main java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space”报错...
在运行如下程序时出现"Exception in thread "main" java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space&quo ...
【Java】Kryo运行报错：Exception in thread “main“ java.lang.IllegalArgumentException:Class is not registered
练习代码如下: import com.esotericsoftware.kryo.Kryo; import com.esotericsoftware.kryo.io.Input; import com ...

2021.11.23【bug笔记】丨picard运行报错：Exception in thread “main“ java.lang.UnsupportedClassVersionError

项目场景：

问题描述：

原因分析：

解决方案：

2021.11.23【bug笔记】丨picard运行报错：Exception in thread “main“ java.lang.UnsupportedClassVersionError相关推荐

最新文章

热门文章