freesurfer对结构像分割流程及批处理代码

  • 概述
  • freesurfer对结构像分割流程
  • freesurfer批处理代码
  • recon-all 并行运行

概述

FreeSurfer 是一个能够分析结构 MRI 图像的软件。换句话说,您可以使用 FreeSurfer 来量化大脑特定区域的灰质和白质的数量。 您还可以计算不同组织类型的皮层厚度、曲率和灰质体积,表面积等测量值。

freesurfer对结构像分割流程

下面给出freesurfer批处理流程:

freesurfer批处理代码

下面给出批处理代码,核心命令recon-all.

#!/bin/bashexport SUBJECTS_DIR=/home/xiaoming/document/T1wprogram/recon_all_T1w
T1wdata=/home/xiaoming/document/T1wprogra

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