Clustalx的操作

第一步：输入序列文件。

第二步：设定比对的一些参数。

参数设定窗口。

第三步：开始序列比对。

第四步：比对完成，选择保存结果文件的格式

相关问题

CLUSTALX－是CLUSTAL多重序列比对程序的Windows版本。Clustal X为进行多重序列和轮廓比对和分析结果提供一个整体的环境。

这里总结一下在使用ClustalX做序列比对过程中一些常见的问题~

1，从网上看来说CLUSTALX软件使用的时候，开始要输入FASTA格式准备的DNA序列test.seq文件。请问这种文件怎么生成啊?记事本?

其实没有规定的文件名，不一定是叫test.seq，任何你想要的都可以，除了中文名（下面会说明）。主要里面的内容是正确的格式就行了~。Clustal支持的格式有多种，如NBRF/PIR, EMBL/SWISSPROT, Pearson (Fasta), Clustal (*.aln), GCG/MSF (Pileup), GCG9/RSF and GDE等

2，什么使用ClustalX时，总是导入不了序列，出现 ERROR:Can not open output file??

这个问题挺多人碰到过的~这是因为你导入的文件的路径包含有中文名。把文件放在其它地方看看。最好路径也不要有空格了。当然前提是你的格式要正确了。这个问题同样适用于ClustalW或其它dos类的软件

3，ClustalX比对后的结果中.aln文件是什么？

这个是序列比对结果的文件。关于这部分，你可以看如何把clusterX的结果转为漂亮的图片

4，ClustalX比对后的结果中.dnd文件是什么？

这个文件是系统进化树文件，需要装TreeView软件才能看（用Dnaman也可以的），进化树显示工具TreeView的下载地址：http://taxonomy.zoology.gla.ac.uk/rod/treeview.html

转载于:https://www.cnblogs.com/triple-y/p/10149511.html

clustalX2使用以及相关的问题相关推荐

  1. Redis 笔记（02）— keys 键相关命令（查询数据库key数量、判断key是否存在、指定key过期时间、查看key类型、查看key剩余秒数、选择数据库、删除key、删除数据库）

    1. keys 键相关命令 命令 说明 dbsize 返回当前数据路的key数量 exists key 测试指定key是否存在 expire key seconds 为key指定过期时间 type k ...

  2. 国民技术芯片相关产业研发

    国民技术芯片相关产业研发 国民技术股份有限公司--塑造网络社会信息安全DNA,以原始创新技术满足人们安全便捷的网络生活需求.2000年公司成立,是承担国家"909"超大规模集成电路 ...

  3. C++ OP相关注意事项

    C++ OP相关注意事项 Paddle中Op的构建逻辑 1.Paddle中Op的构建逻辑 Paddle中所有的Op都继承自OperatorBase,且所有的Op都是无状态的,每个Op包含的成员变量只有 ...

  4. 2021年大数据HBase（十四）：HBase的原理及其相关的工作机制

    全网最详细的大数据HBase文章系列,强烈建议收藏加关注! 新文章都已经列出历史文章目录,帮助大家回顾前面的知识重点. 目录 系列历史文章 HBase的原理及其相关的工作机制 一.HBase的flus ...

  5. 2021年大数据HBase（五）：HBase的相关操作JavaAPI方式

    全网最详细的大数据HBase文章系列,强烈建议收藏加关注! 新文章都已经列出历史文章目录,帮助大家回顾前面的知识重点. 目录 系列历史文章 前言 HBase的相关操作-JavaAPI方式 一.需求说明 ...

  6. 2021年大数据HBase（四）：HBase的相关操作-客户端命令式！【建议收藏】

    全网最详细的大数据HBase文章系列,强烈建议收藏加关注! 新文章都已经列出历史文章目录,帮助大家回顾前面的知识重点. 目录 系列历史文章 前言 HBase的相关操作-客户端命令式 1.进入HBase ...

  7. 2021年大数据Spark（二十五）：SparkSQL的RDD、DF、DS相关操作

      目录 RDD.DF.DS相关操作 SparkSQL初体验 SparkSession 应用入口 获取DataFrame/DataSet 使用样例类 指定类型+列名 自定义Schema ​​​​​​​ ...

  8. 【网站汇总】论文相关

    目录 一.文献检索 1.Connected Papers 2.Slager 3.papers with code 4.arXiv 二.文献管理 1.Mendeley 一.文献检索 1.Connecte ...

  9. 论防止爆T的重要性：N相关孪生素数

    N相关孪生素数 Time Limit: 1 Sec  Memory Limit: 128 MB   64bit IO Format: %lld Description 如果A和B都是素数,而且A和B相 ...

  10. Python学习笔记17：标准库之数学相关（math包，random包）

    前面几节看得真心累.如今先来点简单easy理解的内容. 一 math包 math包主要处理数学相关的运算. 常数 math.e   # 自然常数e math.pi  # 圆周率pi 运算函数 math ...

最新文章

  1. python默认的一个代码缩进是几个空格_python缩进长度是否统一
  2. 干货：排名前 16 的 Java 工具类！
  3. windows server 2003中继代理
  4. event loop、进程和线程、任务队列
  5. 图书馆可以借到的书目
  6. stringwriter_Java StringWriter toString（）方法与示例
  7. f12获取网页文本_8招教你快速搞定网页内容禁止复制粘贴，想怎么复制就怎么复制...
  8. WPF 使用NotifyIcon控件
  9. mysql+导入+306_mysql常用命令二
  10. 计算机辅助正畸学模型分析,计算机辅助口腔正畸算法研究
  11. C# 获取COM控件注册状态，注册以及反注册COM控件
  12. cocos2d-x基于windows平台交叉编辑android工程
  13. 毕业设计——房屋租赁管理系统
  14. 国密算法c语言实现,求 国密sm2 算法 第四部分 公钥加密算法 c语言实现代码,该怎么解决...
  15. 【JAXP】Dom方式解析XML文件
  16. 用nodejs搭建代理服务器
  17. maya如何查看资源大纲_怎样才算入门了Maya
  18. bcprov-jdk15on 简介、中文文档、中英对照文档 下载
  19. 华农大学计算机专硕,华南农业大学电子工程学院（人工智能学院）林芳老师课题组招收计算机方向学硕及专硕...
  20. ReactNative 深层连结

热门文章

  1. MySQL-存储过程-高效清理数据
  2. 移动前端开发和web前端开发的区别
  3. idea java maven 打包,idea maven项目 基于idea自己打包方式 以及使用maven插件打包的三种方式...
  4. 在VMware16虚拟机安装Ubuntu详细教程
  5. PDF连接服务器信息,远程连接服务器.pdf
  6. Geos库学习之（四）——几何对象空间关系判断实例
  7. npm使用及cmd常用命令
  8. wkt文件java解析_WKT文件解析 以及各个投影坐标的wkt参数查询 | 学步园
  9. PS学习笔记一：跟着李涛学PS第一讲——光和色的关系
  10. 马云给阿里的礼物：90多项区块链专利，全球最多