Graphpad prim 和 SPSS 绘制 Bland-Altman 图
原文地址:http://mp.163.com/v2/article/detail/EMC5UAF70516C2JV.html
首先,我们把Prism打开,这里使用Prism 8进行演示,各版本的界面可能稍有差异,但差别不大。
打开软件后,左边选择“Column”,数据表里选择“Start with sample data to follow a tutorial”,之后下面会出现选择,找到“Bland-Altman method comparison”。(老版本比如Prism6,“Column”—“use tutorial data”—在下拉菜单中选择“Bland-Altman method comparison”):
点击“Create”后出现如下界面,即数据输入界面,包括软件提供的演示数据,以及作图的简介:
我们将需要检验的数据,直接复制粘贴至数据输入界面:
数据有了,我们找到上面工具栏中“Analyze”进行分析作图:
在跳出的对话框中,找到“Bland-Altman method comparison”,点击OK:
之后,系统会让你进行数据的选择,“Data sets”我们仅输入两组数据,因此默认无需更改。
计算方式: 第一种就是“差值vs均值”,第二种是“比值vs均值”,这两种方法我们之前介绍过。另外,Prism还提供了其他方法,如百分比的差异,或者两种方法反过来比较。
这里我们以第一种,也是最常用的一种为例:
结果有两大部分,第一部分主要是数据结果,包括差值的均数Bias,标准差,95%置信区间的上限和下限:
第二部分就是图,下图是初步生成的B-A图,我们需要对这个图进行适当的美化,添加Bias和95%CI的线:
双击Y轴,弹出如下对话框,均值线和95%CI的线需要通过添加额外的Y轴的线来完成(Additional ticks and grid lines),点击下图“Details”:
出现的对话框中,软件已经提供了我们需要的值,先选择“Bias”:
这样框中的Y值就有了,然后我们根据需要,设置一下Bias线的样式:
点击OK后“Additional ticks and grid lines”中就有了Bias的线:
最后,我们需要的线就有了:
我们还可以根据需要,对图形进行美化:
这就是“差值vs均值“的Bland-Altman图的绘制方法,如果需要“比值vs均值”的图,只需要在选择计算方式时选择相应方法即可!
SPSS实操
首先将数据准备好: A测量方法和B测量方法,A法与B法的差值 difference ,A与B的平均值 average ,A与B的比值 ratio 。
首先演示“用差值进行Bland-Altman分析”,散点图X轴选择average,Y轴选择difference:
双击图像进行编辑和美化,添加拟合线(Bias线):
添加95%CI的线:
依次输入95%CI,添加相应的线:
线添加好了,之后别忘了美化一下图形:
图像美化:
如果是“ 用比值进行Bland-Ahman分析 ”,那么Y轴选择ratio:
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