下载VMD

参考的是昌南何许人的教程

sudo apt-get instal csh libstdc++5wget http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/vmd-1.9.3/files/final/vmd-1.9.3.bin.LINUXAMD64-CUDA8-OptiX4-OSPRay111p1.opengl.tar.gzgunzip vmd-1.9.3.bin.LINUXAMD64-CUDA8-OptiX4-OSPRay111p1.opengl.tar.gz tar -xvf vmd-1.9.3.bin.LINUXAMD64-CUDA8-OptiX4-OSPRay111p1.opengl.tarcd vmd-1.9.3
sudo  ./configure LINUXAMD64
sudo ./configure
cd src
sudo make install

前面的步骤都没有遇见问题,之后直到最后的sudo make install,无法运行。后来尝试make install,界面出现提示,按照提示操作后重复sudo make install就安装好了。
同时我采用同样的方法下载了NAMD,并解压

wget https://www.ks.uiuc.edu/Research/namd/cvs/download/741376/NAMD_Git-2019-12-03_Linux-x86_64-multicore.tar.gz
gunzip NAMD_Git-2019-12-03_Linux-x86_64-multicore.tar.gz
tar -xvf NAMD_Git-2019-12-03_Linux-x86_64-multicore.tar

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