2天让你从零基础到手握3-5生信热点分文章 线上课程8月7-8日
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如你没时间参加 朋友圈转发2小时发送截图,或介绍学员,核实后可在授课结束后获得 PPT《WGCNA分析流程指南》 一份。
课程简介
示例数据有何用?课堂实战,帮助学员下载并分析自己数据,出现问题,当场解决
没有售后的产品都是假产品:课后学员个人数据分析的1对1指导和批改,实在不会,老师帮你完成结果分析;
我的承诺:课后1周内帮学员完成自己的数据分析过程,轻轻松松快速发文章。
课程目标
(1)没有课题时,自己找到课题;没有机制时,自己找到机制;
(2)让自己SCI文章或国自然项目内容更夯实,思路逻辑更完美;
(3)思路缺乏创新性,怎么办?老师给你最新的生信分析热点;
(4)掌握R语言的核心技能,掌握批量分析方法,掌握顶层计算机思维体系;
(5)科研绘图小case,DIY自己CNS级的精美图片;
(5)掌握生信分析的独家套路(5个套路供你选择);
涉及的生信热点
(1)单基因泛癌分析;(2)蛋白质相互作用网络;(3) 免疫微环境;(4)ceRNA网络构建;(5)细胞焦亡的分析流程;(6)Multi-omics分析。
涉及到的31个议题
1,没有课题时,如何找课题、找线索、找机制?
2,后续细胞实验,如何精准找到下游作用通路或因子?
3,花钱测序回来的一堆结果,乱七八糟,怎么梳理、再分析成一篇SCI论文?
4,gene signature类文章的一些禁忌,哪些是评审专家特别看重,一票否决的点?
5,当下热门的免疫微环境是怎么回事,怎么利用自己的数据进行操作?
6,审稿人说只有生信分析,没有实验验证,怎么办?,
7, TCGA数据库中的数据,怎么下载,需要进行哪些数据清洗?
8,文章写好了,怎么选刊,避免踩雷?
9,WGCNA是什么东西,为什么是生信分析的神器?
10,生存分析有几种方案?怎么进行批量操作?
11,免疫浸润的计算方法有多少种,怎么多种方法批量分析?
12,目前有什么热点,怎么结合热点,发出不一样的生信文章?
13,单基因生信分析,能做到什么程度?
14,两个基因,能进行什么生信分析,产生多少结果用于SCI文章中?
15,一群基因,能进行什么生信分析,产生多少结果用于SCI文章中?
16,如何利用生信挖掘,没有试验前期,也能写课题中标书?
17,差异表达分析怎么做、配对样本怎么做,多组样本怎么做,小样本怎么做,大样本怎么做?
18,GSEA基因集富集分析,优点是什么,缺点是什么,怎么做?CNS的大牛文章中到底是怎么用GSEA的?怎么在文章或课题里利用GSEA加分?
19,ceRNA网络怎么构建? 对于mRNA,miRNA,lncRNA,cirRNA,我们应该做些什么?
20,GE0芯片数据,除了热图、火山图,还能做什么?
21,那么多GEO平台,如何以不变应万变的进行探针ID转换?
22,GEO多芯片数据,如何进行批次效应的处理?
23,ssGSEA算是批次效应的终结者吗?批次效应的终结者到底是什么?
24,如何对长链非编码RNA、假基因等一网打尽的注释?
25,单基因GSEA怎么做?有什么用途?跑出的结果怎么挑选和分析?
26,TCGA数据的正常和癌组织怎么分组,转移和未转移怎么分组,配对样本怎么挑选?
27,如何从TCGA数据中提取出lncRNA?
28,同一基因出现不同的分析结果,我该信谁?
29,做通路分析时,肺癌的数据聚类出肝癌的通路,这是怎么回事?
30,我想进一步学习,但害怕四处折腾踩雷,有什么避雷指南?
31,别人生信学3个月或学半年,我怎么学,才能后来居上,超过他们?
课程讲师
百川老师,知名三甲医院多年科研狗,发表SCI文章50余篇,撰写国自然及省市级课题10余项,数家SCI杂志审稿人,具有丰富的科研教学和培训经验。教学特点:呆滞刻板、不苟言笑、静若处子、动如树懒。他,将陪伴你们度过你2天的互动式教学,以及随后数个夜晚1V1指导,来吧。
课程设置
日期 |
主要培训模块 |
第一天 |
上 午 |
8:30-11:30 |
R语言基础知识介绍; R语言数据结构及循环控制(向量、因子、矩阵、数据库、列表、for循环、if控制) DIY自己的人生第一个批量处理函数 R语言数据框的操作 高通量测序数据的的清洗、整理 R包及bioconductor资源的使用 R包的多种安装模式 R语言绘图原理及体系 R语言读入及读出 |
第一天 |
下 午 |
13:30-17:00 |
GEO数据的处理流程演示及学员实战(数据清洗、热图、火山图、GO分析、KEGG分析、共表达分析) GEO数据的GSEA分析的全套流程及结果的诠释 GEO芯片的probe探针的转化方法汇总 多个GEO芯片联合分析; TCGA数据的下载; 任意癌症任意基因在癌和癌旁的表达分析; 同一癌症不同亚型和不同分期的表达分析; 单基因在多个正常组织中的表达分析; 单基因在多个癌组织中的表达分析; 单基因在多个癌和癌旁中的表达分析; 两个基因相关性分析; |
第一天晚上 |
学员分析和整理自己数据的结果,并发送作业给老师批改,不合格的学员 1V1单线辅导。 |
第二天 |
上 午 |
8:30-11:30 |
差异分析(从表达矩阵的整理、归一化、标准化到差异分析、多组差异分析、配对差异分析) ceRNA的理论体系,如何寻找关键基因的ceRNA网络进行后续实验。 必备小技能:注释任何一个基因,包括非编码RNA 单基因生存分析 多基因生存分析 生存分析傻瓜式作图 LASSO回归是什么东西,为什么在筛选基因中非常重要,怎么傻瓜式实操? 蛋白互作网络构建、cytoscape的实操使用,MCODE的实操; Oncomine数据库的使用详解; |
第二天 |
下 午 |
13:30-16:30 |
怎么利用TCGA/GEO数据库中找课题? 怎么利用TCGA/GEO挖掘下游机制? 如何利用TCGA/GEO数据库申请国自然? 如何利用TCGA/GEO数据库发表文章? 实战环节: 现场指导学员DIY自己的科研设想; 下载自己所需的数据或自己已有的样本测序数据导入R语言(每个人各不相同); 对数据进行清洗、整理; 每个分析步骤的一步一步,“我在讲,你在做,不懂你就问”的DIY环节; 绘制你的SCI文章所需图表内容。 |
【主办单位】
玮瑜科研平台
【承办单位】
上海玮瑜生物科技有限公司
上海焦务科技服务中心
【注册费用】
3400元/人 两班连报6000元/人 和其他两天课程一起报名
可开会务费 注册费 检测费 分析服务费等发票
【时间地点】
2021年8月7-8日:周末两天一夜线上集中授课 可互动
【汇款账号】
A:汇款账户
账户名称:上海焦务科技服务中心
账 户 号:9734 0078 8012 0000 0311
开 户 行:上海浦东发展银行大华支行
B:支付宝转账
收款人:wybiot@163.com 支付宝户名:上海玮瑜生物科技有限公司
C:信用卡或公务卡支付
微信或支付宝扫描二维码支付,通过信用卡/公务卡扣款
【联系人】
联系人:谢老师 13611825136
报名邮箱:wybiot@126.com
【报名方法】
报名方法一:邮箱报名:您编辑您的姓名、手机号码 参加班级发送到wybiot@126.com邮箱
报名方法二:在线报名:
其他课程安排 关注我们 点击近期会一和近期会二
7.23开始 |
线上 |
详情请点击:包教包会学影像组学应用和SCI论文写作 |
8.5开始 |
线上 |
详情请点击:CNS文章的生信分析怎么做?包教包会学单细胞测序、chipseq、RNAseq、Atacseq、R语言 |
7.24-25 |
线上 |
详情请点击:肠道菌与代谢研究课题设计、实验数据分析 |
7.24-25 |
线上 |
详情请点击:教会您独立完成Meta分析和网状Meta分析 |
7.31-8月1日 |
线上 |
详情请点击:张教授“一站式”SCI论文写作学习班 |
8.7-8 |
线上 |
详情请点击:挖掘单细胞测序公共数据库来发表文章 |
8.7-8 |
线上 |
详情请点击:两天让你从零基础到手握3-5生信热点分文章 |
8.14-15 |
线上 |
详情请点击:不做实验不写meta分析如何快速发文章 |
8.14-15 |
线上 |
详情请点击:如何利用R语言挖掘TCGA、GEO等公共数据库发表文章 |
8.14-15 |
线上 |
详情请点击:Sci论文插图机制模式图 |
8.14-15 |
线上 |
详情请点击:利用网络药理学和分子对接技术发高分文章和网络药理学图表制作 |
8.14-15 |
线上 |
详情请点击:空间转录组数据挖掘、研究思路与课题设计学习班 |
8.14-15 |
线上 |
详情请点击:一对一包教会多模态脑影像数据的处理与分析培训班 |
8.21-22 |
线上 |
详情请点击:临床科研设计与统计分析实战 |
8.21-22 |
线上 |
详情请点击:DNA及RNA甲基化数据分析、课题设计与基金写作学习班学习班 |
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合作方式:线下或线上课程皆可
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