Metalims安装

1软件版本

Apache 2.2.15 , MySQL 5.5.43 (noSTRICT_TRANS_TABLES mode), PHP 5.5.25 (with mysqli module), phpmyadmin 4.4.9

2安装lamp

在自己主目录下创建lamp.sh,lamp内容在GitHub上可以找到,将其内容复制粘贴到lamp.sh(一定要用vim编辑器,千万不要使用Windows下的编辑器,格式会出现问题)

使用source lamp.sh 命令就可以自动安装了,安装过程中需要输入数据库密码,一定要记住!

3安装metalims

在自己主目录下创建 metalims.sh 其内容可在GitHub上找到,将其内容复制粘贴到metalims.sh下(一定要用vim编辑器,千万不要使用Windows下的编辑器,格式会出现问题) 使用source lamp.sh 命令就可以自动安装了,等待时间较长,

4登录metalims

使用http:// ip地址/MetaLIMS/login.php   登录

密码admin

Metalims 可以实现的功能主要是储存样本采集和处理过程中的元数据,例如DNA提取细节,下游测序,分析流程。

关于测序数据:这并不创建提交,而是将信息存储为用户的记录保存。用户可以输入已读的提交名称、提交日期和包含示例的实验类型

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