人类染色质开放状态数据库，ATACdb使用介绍

对于转录因子预测而言，我们昨天的数据库介绍当中也提到了。转录因子主要是通过识别DNA序列当中的基序(motif)来调控目标基因的。所以其实我们在知道了一个基因的motif的时候就差不多能找到这个转录因子都和哪些位置结合了。但是对于预测的结果和现实还是有区别的。因为真核生物的核DNA并不是裸露的，而是与组蛋白结合形成染色体的基本结构单位核小体，核小体再经逐步的压缩折叠最终形成染色体高级结构。只有当DNA复制的时候，核小体才会打开，进而转录因子这些的才能进行调控。这部分打开的染色质，就叫开放染色质，打开的染色质允许其他调控因子结合的特性称为染色质的可及性（chromatin accessibility）。

因此对于预测一个转录因子调控的话，需要在其开放染色质的基础上预测到的结果才算是准确的。所以今天就介绍一个预测人类染色体开放状态的数据库: ATACdb[地址见文末].

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