视网膜眼底图的数据库介绍

**视网膜血管分割方法是眼科计算机辅助诊断和大规模疾病筛查系统的基础，针对彩色视网膜眼底图的分析，有助于医生在对于人体的无伤害医学诊断，尤其在人类的高血压、青光眼、糖尿病等疾病的诊断就有显著的效果。目前公开常用的彩色眼底图数据库主要有一下几种：

1、STARE数据库（structured snalysis of the retinal）

**STARE 是 1975 年由 Michael Goldbaum 发起的项目, 它在 2000 年由 Hoover 等首次在论文中引用并公开，是用来进行视网膜血管分割的彩色眼底图数据库, 包括 20 幅眼底图像, 其中 10 幅有病变, 10 幅没有病变, 图像分辨率为 605×700, 每幅图像对应 2 个专家手动分割的结果, 是最常用的眼底图标准库之一.。但是其自身的数据库中没有掩膜，需要自己手动设置掩膜。目前它已扩展到 40 幅血管分割手工标注结果和 80 幅视神经检测手工标注结果。

2、 DRIVE(digital retinal images for vessel extraction)

**DRIVE是 Niemeijer 团队在 2004 年根据荷兰糖尿病视网膜病变筛查工作建立的彩色眼底图库。其图像是从 453 名 25~90 岁的不同个体拍摄得到,随机抽取了其中 40 幅, 其中 7 幅是有早期糖尿病视网膜病变的, 33 幅是没有糖尿病视网膜病变的眼底图, 每幅图像的像素为 565×584. 分成训练集和测试集, 每个子集 20 幅图像, 每幅图像对应 2个专家手动分割的结果. 其自身有专门的掩膜，调用方便。比较好的运用到监督学习和深度学习的图像训练当中。该库是衡量视网膜血管分割方法性能好坏的最常用数据库。

3、MESSIDOR(methods for evaluating segmentation and indexing techniques dedicated to retinal ophthalmology)

**MESSIDOR是由法国国防研究部在 2004 年资助研究的 TECHNO-VISION 项目中建立的, 也是目前公开的最大的眼底图数据库, 共 1200 幅眼底图, 来自于 3 个不同的眼科机构. 其中图像分辨率分别为 1440×960, 2240×1488 和 2304×1536, TIFF 格式; 它给出了对应糖尿病视网膜病变分期和黄斑性水肿症状, 同时给出了专家手动标定的视盘, 也是常用的眼底图像库。

4、Review(retinal vessel image set for estimation of widths)

**Review 是 2008 年由英国林肯大学公开的眼底图库[11], 主要用于血管宽度的检测, 包括 16 幅眼底图, 由 3 位专家手工标注 193 段血管共 5066 个轮廓点; 其中有高分辨率、血管病变和血管中央高亮的图像。

5、ROC (retinopathy online challenge)

**ROC是一个用于 DR 筛查竞赛的眼底图库, 于 2009 年由 Iowa 大学公开, 包括 100 幅含有 DR病变、微动脉瘤的眼底图像, 其中幅做训练集, 50幅做测试集; 并有 3种不同分辨率的彩色眼底图像, 分别为 768×576, 1058×1061, 1389×1383。

总结：

**小白一枚，今年刚进课题组，研究医学图像处理。STARE和DRIVE数据库可以参考希望以后对自己有所帮助吧！

参考文献：

[1] 彩色眼底图像视网膜血管分割方法研究进展[f].计算机辅助设计与图形学学报,2015,27(11):2046-2057
[2]Hoover A, Kouznetsova V, Goldbaum M. Locating blood vessels in retinal images by piecewise threshold probing of a
matched filter response[J]. IEEE Transactions on Medical Imaging, 2000, 19(3): 203-210
[3] Staal J J, Abramoff M D, Niemeijer M, et al. Ridge based vessel segmentation in color images of the retina[J]. IEEE Transactions on Medical Imaging, 2004, 23(4): 501-509
[4] Niemeijer M, Staal J J, van Ginneken B, et al. Comparative study of retinal vessel segmentation methods on a new publicly available database[C] //Proceedings of SPIE. Bellingham: Society of Photo-Optical Instrumentation Engineers Press, 2004,5370: 648-656