R软件--GEO数据分析教程：差异性分析、富集分析（GO\KEGG\DO）

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关于GSE93798的差异性分析、GO分析、KEGG分析、DO分析

rm(list = ls()) #RStudio控制台(console)中出现少量中文乱码的解决方法
Sys.setlocale("LC_ALL","Chinese")# if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
#   install.packages("BiocManager")
# BiocManager::available()
#
# options(BioC_mirror="http://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")library(BiocManager)#BiocManager::install('limma')
library(limma)#install.packages("ggplot2")
library(ggplot2)exp<-read.table("GSE93798_series_matrix1.txt",header = T,row.names = 1,comment.char = "!")annot<- data.table::fread("GPL570.annot.gz",skip ="ID",data.table

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