KEGG Drug 数据库

kegg drug 数据库是一个药物相关信息的综合数据库，包括了在日本，美国，欧洲上市的的药物。所有在日本上市的药物，不论处方药还是非处方药，包括天然药物和中药，都会在Drug 数据中有对应的记录；对于在美国和欧洲上市的药物，只有一部分处方药的信息在drug 数据库中有记录。

根据化学结果和化学组分的不同，将药物进行区分，酶中药物用D number 进行标识，比如 D014441 ，是一种作用于慢性粒细胞白血病的药物。对于每种药物，记录了其通用名，化学结构，靶标基因，相关的代谢酶，转运蛋白等各种信息，以D014441 为例，来详细看下。

字段	含义
Entry	D number
Name	通用名和注册的商品名
Products Generic	DailyMed 数据库的链接
Formula	分子式
Exact mass	质量
Mol Weight	分子量
Structure	化学结构
Simcomp	结构相近的其他分子
Class	DGROUP 数据库定义的分类
Efficacy Diseasee	作用的疾病
Target Pathway	药物的靶标对应的人类基因和这些靶标参与的通路
Metabolism	药物代谢相关的酶
Structure map	pathway数据库的通路图
Brite	在brite 数据库中的分类信息

在结构相似性和功能相似性的基础上，建立了KEGG DGROUP 数据库，对药物进行了分类，每个group 用DG 编号开头。在DGROUP 数据库中，有两种类型的group：

1. 第一种下面只包含对应的药物，这些药物的化学结构相近，比如DG00710包含D08066和 D01441 两种药物

2. 第二种group还会包含下一级的group,这种其实是按照功能，分成了不同的层级，比如DG01918 同时包含了药物D10223和group DG01917;

除了KEGG DGROUP 数据库，brite 数据库也有药物的分类信息，但是分类的标准特别多。

很多的新药，其实只是在已有药物的基础上，保留核心的化学结构，其他基团稍作变化而成的，了解这种化学结构的变化，可以为我们在药物开发领域提供一定的参考。所以kegg 专门在pathway 数据库中，将各种药物化学结构的转变绘制了对应的通路图，叫做Structure map , 所有是Structure map组成了pathway 数据库中的一大类别，叫做 Drug Development。

map07011 对应的图片如下

总结

1. drug是药物相关信息的综合性数据库，涵盖了所有在日本上市的药物以及部分在美国和欧洲上市的处方药；
2. 根据化学结构的不同，对每种药物进行区分，用D Number 来唯一标识每种药物，在数据库中记录了药物的化学结构，靶标基因，代谢相关的酶等基本信息；
3. 对于药物的分类，KEGG GROUP 数据库根据结构和功能的相似性对药物进行分类，brite数据库则提供了更加多的分类标准；
4. 关于不同药物间化学结构的改变，在pathways数据库中专门有一个叫做Drug Development的类别来进行记录；

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