维恩图（Venn diagram），或译Venn图、文氏图、温氏图、范氏图，是用以表示集合（或类）的一种图。

大家对这种图应该不陌生，他们长这样：

或是这样：

以及,这~~样~~~~

在数据可视化图片中，venn图可以算得上是百花齐放各有特色了。

那么如何绘制这样”花里胡哨”的venn图呢?

今天，小鹿就给大家带来venn图的千条道路，条条大路通罗马，必有一款适合你!

首先是方便使用的在线绘图工具~~

1.Venn Diagram Generator

该工具只能画2-4个集合的venn图，使用方便，但图形缺乏美观度。

网址：

http://www.pangloss.com/seidel/Protocols/venn.cgi

2.Venny 2.1

该工具最多能画4个集合，优点：相较于上一个增加了图形颜色线条字体类型的可选项，可以查看集合包含的元素情况，是比较推荐的简单方便的venn图绘制工具。

网址：

https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html

3.BioVenn

该工具支持直接传输文件，可以自定区域颜色和大小，但是只能最多画3个集合的图。比较适合集合较少的情况下使用~~

4.Calculate and draw custom Venn diagrams

该工具可以直接传输文件，同时提供最多30个集合的，但是5个集合以上无法形成venn图，只能提供数据列表。

地址：

http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/

5.Jvenn

可以绘制最多6个组的venn图，颜色字体及字体大小，图例的显示等等参数，同时提供点击数字查看集合内容的功能，是非常方便的一个在线venn图作图工具，墙裂推荐!

地址：

http://jvenn.toulouse.inra.fr/app/example.html

6.欧易/鹿明生物云平台

可以绘制5个组的venn图，及5个组以上的upset图，提供批量文件传输和作图功能,，可以下载结果查看交集并集等信息，右侧有详细的使用方法，是最好用的venn图绘制工具!

地址：

https://cloud.oebiotech.cn/task/venn-array/

在线的venn图绘制工具已经可以满足绝大多数人的需求，但我们做科研的就是要有一股努力进取，不断学习的精神劲头，所以接下来是更深入的R语言venn图实战环节!

给所有走到这一步还想继续下去的小伙伴们鼓掌!

R语言VennDiagram包是最常用的画Venn图的包，这个包支持1-5个集合的Venn图的绘制。

小鹿将以5个组的韦恩图为例，给大家展示VennDiagram包的基础用法。

1.安装VennDiagram包并加载

install.packages("VennDiagram")

library(VennDiagram)

2.数据准备

我们准备一个5个集合的data数据

3.初步代码撰写

venn.diagram(x=list(DESeq = data$DESeq,

FQ = data$FQ,

RPKM=data$RPKM,

TC=data$TC,

TMM=data$TMM),

filename = "Venntest2.tif"),

选定画图的数据x,使用x=list()选择集合及集合名，然后选择导出的图片名称。

4.修整

我们可以看到，图片是没有颜色的，边缘的字体越出了边框，图片没有标题等等的一些问题，需要我们进一步修整，接下来就是美化的环节了。

我们首先给图片首先设置一个大小和分辨率:

resolution = 300,

height = 4000,

width = 4000,

然后给图片填充颜色:

fill=c("dodgerblue", "goldenrod1", "darkorange1", "seagreen3", "orchid3")

设置图片标题,标题字体和大小和集合的字体大小位置。

main="Venn",

main.cex = 2,

main.fontface = 2,

cat.cex = 1.5,

cat.fontface=2,

sub.just =c(0.5, 1)

优化后的代码是:

venn.diagram(x=list(DESeq = data$DESeq,

FQ = data$FQ,

RPKM=data$RPKM,

TC=data$TC,

TMM=data$TMM),

resolution = 300,

height = 4000,

width = 4000,

fill=c("dodgerblue", "goldenrod1", "darkorange1", "seagreen3", "orchid3"),

filename = "Venntest2.tif",

main="Venn",

main.cex = 2, main.fontface = 2,

cat.cex = 1.5,cat.fontface=2,

sub.just =c(0.5, 1))

最终成图是这样的:

欢迎大家踏入VennDiagram包作图和优化的大门，作图和美化的过程中，还需要大家不断尝试才能得到符合自己心仪的图片哦!

如果大家对更多内容感兴趣，可以翻阅VennDiagram包的说明,根据说明深入研究探索哦!

VennDiagram包说明: https://rdrr.io/cran/VennDiagram/man/venn.diagram.html

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​文章来源于鹿明生物