划分聚类是用于基于数据集的相似性将数据集分类为多个组的聚类方法。

分区聚类,包括:

K均值聚类 (MacQueen 1967),其中每个聚类由属于聚类的数据点的中心或平均值表示。K-means方法对异常数据点和异常值敏感。

K-medoids聚类或PAM(_Partitioning Around_ Medoids,Kaufman和Rousseeuw,1990),其中,每个聚类由聚类中的一个对象表示。与k-means相比,PAM对异常值不太敏感。

CLARA算法(_Clustering Large Applications_),它是适用于大型数据集的PAM的扩展。

对于这些方法中的每一种,我们提供:

基本思想和关键数学概念

R软件中的聚类算法和实现

R用于聚类分析和可视化的示例

数据准备:

my_data

## Murder Assault UrbanPop Rape ## Alabama 1.2426 0.783 -0.521 -0.00342 ## Alaska 0.5079 1.107 -1.212 2.48420 ## Arizona 0.0716 1.479 0.999 1.04288

确定k-means聚类的最佳聚类数:

fviz_nbclust(my_data, kmeans, method = "gap_stat")

## Clustering k = 1,2,..., K.max (= 10): .. done ## Bootstrapping, b = 1,2,..., B (= 100) [one "." per sample]: ## .................................................. 50 ## .................................................. 100

计算和可视化k均值聚类:

fviz_cluster(km.res, data = my_data, ellipse.type = "convex", palette = "jco", repel = TRUE, ggtheme = theme_minimal())

同样,可以如下计算和可视化PAM聚类:

pam.res

r语言dataellipse_R语言中的划分聚类模型相关推荐

  1. r语言dataellipse_R语言绘图:28个实用程序包

    原标题:R语言绘图:28个实用程序包 全文注释 # 示例参考帮助文档 # 我用Rstudio重现了所有示例 # 初识R语言,请戳我的原创推文""与"" # 使用 ...

  2. r语言dataellipse_R语言 PCA分析

    PCA数据分析 PCA结果分析及可视化首推factoextra包,能处理各种R函数计算PCA的结果,有: stats::prcomp() FactoMiner::PCA() ade4::dudi.pc ...

  3. R语言ggplot2可视化:为层次聚类树状图dendrogram中的簇进行着色、在树状图dendrogram中为不同的层次聚类簇配置不同的色彩

    R语言ggplot2可视化:为层次聚类树状图dendrogram中的簇进行着色.在树状图dendrogram中为不同的层次聚类簇配置不同的色彩 #层次聚类树状图dendrogram labs = pa ...

  4. R语言层次聚类(hierarchical clustering):特征缩放、抽取hclust中的聚类簇(cutree函数从hclust对象中提取每个聚类簇的成员)、基于主成分分析的进行聚类结果可视化

    R语言层次聚类(hierarchical clustering):特征缩放.抽取hclust中的聚类簇(cutree函数从hclust对象中提取每个聚类簇的成员).基于主成分分析的进行聚类结果可视化 ...

  5. R语言KMeans聚类模型示例

    R语言KMeans聚类模型示例 K-means算法是很典型的基于距离的聚类算法,采用距离作为相似性的评价指标,即认为两个对象的距离越近,其相似度就越大.该算法认为簇是由距离靠近的对象组成的,因此把得到 ...

  6. R语言层次聚类模型示例

    R语言层次聚类模型示例 层次聚类(Hierarchical Clustering)是聚类算法的一种,通过计算不同类别数据点间的相似度来创建一棵有层次的嵌套聚类树.在聚类树中,不同类别的原始数据点是树的 ...

  7. 【生信】R语言在RNA-seq中的应用

    R语言在RNA-seq中的应用 文章目录 R语言在RNA-seq中的应用 生成工作流环境 读取和处理数据 由targets文件提供实验定义 对实验数据进行质量过滤和修剪 生成FASTQ质量报告 比对 ...

  8. r语言 col_R语言绘制聚类树示例

    R语言绘制聚类树示例层次聚类(hierarchical clustering)常见两种形式,"自底向上"的聚合策略(层次聚合)或"自顶向下"的分拆策略(层次分划 ...

  9. R语言使用caret包构建随机森林模型(random forest)构建回归模型、通过method参数指定算法名称、通过ntree参数指定随机森林中树的个数

    R语言使用caret包构建随机森林模型(random forest)构建回归模型.通过method参数指定算法名称.通过ntree参数指定随机森林中树的个数 目录

最新文章

  1. 心得丨程序员们,AI来了,机会来了,危机也来了,我们该咋办?
  2. 单调不减序列查询第一个大于等于_[力扣84,85] 单调栈
  3. 微信小程序云开发 mysql_微信小程序云开发学习笔记(一)云数据库
  4. BZOJ 1491: [NOI2007]社交网络( floyd )
  5. Javascript Math ceil()、floor()、round()三个函数的区别
  6. php中数字字符串转换为字符串,php如何实现数字转字符串,php字符串转换为数字...
  7. 【推荐实践】微博在线机器学习和深度学习实践(文末附PPT下载链接)
  8. 修改caffe源码--支持多标签--关键点检测
  9. BCG菜单button的简单使用
  10. linux shell 脚本中变量截取
  11. 遥感学习笔记(四)——遥感数据分类
  12. zz 超级拖拉机 4.02 破解算法分析
  13. Exchangeable Image File (EXIF)图片信息
  14. 云端服务器部署前端工程
  15. java 异常提示_Java显示异常信息与异常分类
  16. 基于OpenCV做“三维重建”(1)--找到并绘制棋盘
  17. 江苏省2022年普通高校专转本选拔考试 计算机专业大类专业技能 试题卷
  18. 【C语言】ISBN识别码判断
  19. Silent Install Builder制作静默安装包实现软件自动部署
  20. C语言自动出十题四则运算,c语言四则运算出题器

热门文章

  1. 计算机老是卡顿怎么解决,电脑反应太慢怎么处理_电脑卡顿什么原因-win7之家
  2. css 矩形切角,特殊border的样式 -- CSS3实现三种切角效果
  3. 狗跳高案例和学生老师案例(继承,抽象类,接口)
  4. 凌晨4点的大家都在做什么?大数据告诉你
  5. 边缘计算(雾计算)——AI+IoT的热词
  6. 2020040920200418知交零落实是人生常态
  7. python编程入门视频教程-PYTHON编程从0到1(视频教学版)
  8. 试题 算法训练 kAc给糖果你吃(贪心)
  9. Zxing扫码库优化思路
  10. html怎么设置视频不能快进,【浏览器插件】Video Speed Controller – 网页视频倍速、快进、回放功能0.07~16 倍...