(传统安装--生信软件)——FastQC 下载安装
FastQC下载安装
1.首先检查LINUX系统中是否存在perl语言,检查Java版本(如果两者都不存在要首先安装perl和java)
2.开始下载
1.1 mkdir toolszip #创建文件夹
1.2 cd toolzip #进入该文件
1.3 wget http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/download.html #下载 fastqc
3.开始安装
1.1 unzip fastqc_0.11.7.zip #解压文件
1.2 cd FastQC #进入文件当前环境
1.3 ls #查看指定目录所包含的文件信息
1.4 chmod 755 fastqc #更改权限
1.5 ~/Biosoft/FastQC/fastqc -h
echo 'export PATH=~/tools/FastQC:$PATH' >>~/.bashrcsource ~/.bashrc**#此步骤是可以理解为生成fastqc命令,可以在任意文件夹下调用fastqc
1.6 fastqc -h #检查是否可用
tools
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